Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rbbp4Q60972 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbbp4Q60972 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbbp4Q60972 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbbp4Q60972 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbbp4Q60972 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbbp4Q60972 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbbp4Q60972 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbbp4Q60972 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbbp4Q60972 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbbp4Q60972 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbbp4Q60972 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbbp4Q60972 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbbp4Q60972 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbbp4Q60972 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbbp4Q60972 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbbp4Q60972 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbbp4Q60972 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbbp4Q60972 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbbp4Q60972 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbbp4Q60972 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbbp4Q60972 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbbp4Q60972 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbbp4Q60972 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbbp4Q60972 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbbp4Q60972 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbbp4Q60972 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbbp4Q60972 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbbp4Q60972 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbbp4Q60972 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbbp4Q60972 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbbp4Q60972 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbbp4Q60972 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbbp4Q60972 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbbp4Q60972 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbbp4Q60972 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbbp4Q60972 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbbp4Q60972 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbbp4Q60972 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbbp4Q60972 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbbp4Q60972 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbbp4Q60972 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbbp4Q60972 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbbp4Q60972 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbbp4Q60972 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbbp4Q60972 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbbp4Q60972 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbbp4Q60972 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbbp4Q60972 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbbp4Q60972 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbbp4Q60972 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbbp4Q60972 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbbp4Q60972 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbbp4Q60972 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbbp4Q60972 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbbp4Q60972 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbbp4Q60972 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbbp4Q60972 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbbp4Q60972 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbbp4Q60972 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbbp4Q60972 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbbp4Q60972 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbbp4Q60972 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbbp4Q60972 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbbp4Q60972 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbbp4Q60972 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbbp4Q60972 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbbp4Q60972 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbbp4Q60972 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbbp4Q60972 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbbp4Q60972 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbbp4Q60972 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbbp4Q60972 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbbp4Q60972 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbbp4Q60972 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbbp4Q60972 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbbp4Q60972 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbbp4Q60972 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbbp4Q60972 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbbp4Q60972 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbbp4Q60972 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbbp4Q60972 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbbp4Q60972 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbbp4Q60972 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbbp4Q60972 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbbp4Q60972 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbbp4Q60972 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbbp4Q60972 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbbp4Q60972 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbbp4Q60972 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbbp4Q60972 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbbp4Q60972 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbbp4Q60972 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbbp4Q60972 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbbp4Q60972 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbbp4Q60972 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbbp4Q60972 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbbp4Q60972 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbbp4Q60972 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbbp4Q60972 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms