Protein–RNA interactions for Protein: Q60773

Cdkn2d, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor D, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2dQ60773 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkn2dQ60773 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkn2dQ60773 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkn2dQ60773 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkn2dQ60773 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkn2dQ60773 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkn2dQ60773 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkn2dQ60773 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkn2dQ60773 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkn2dQ60773 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkn2dQ60773 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkn2dQ60773 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkn2dQ60773 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkn2dQ60773 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkn2dQ60773 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkn2dQ60773 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkn2dQ60773 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkn2dQ60773 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkn2dQ60773 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkn2dQ60773 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkn2dQ60773 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkn2dQ60773 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkn2dQ60773 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkn2dQ60773 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkn2dQ60773 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkn2dQ60773 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkn2dQ60773 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkn2dQ60773 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkn2dQ60773 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkn2dQ60773 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkn2dQ60773 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkn2dQ60773 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkn2dQ60773 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkn2dQ60773 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkn2dQ60773 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkn2dQ60773 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkn2dQ60773 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkn2dQ60773 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkn2dQ60773 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkn2dQ60773 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkn2dQ60773 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkn2dQ60773 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkn2dQ60773 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkn2dQ60773 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkn2dQ60773 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkn2dQ60773 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkn2dQ60773 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkn2dQ60773 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkn2dQ60773 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkn2dQ60773 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkn2dQ60773 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkn2dQ60773 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkn2dQ60773 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkn2dQ60773 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdkn2dQ60773 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdkn2dQ60773 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdkn2dQ60773 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdkn2dQ60773 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdkn2dQ60773 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdkn2dQ60773 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdkn2dQ60773 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdkn2dQ60773 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdkn2dQ60773 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdkn2dQ60773 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdkn2dQ60773 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdkn2dQ60773 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdkn2dQ60773 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdkn2dQ60773 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdkn2dQ60773 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdkn2dQ60773 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdkn2dQ60773 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdkn2dQ60773 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdkn2dQ60773 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdkn2dQ60773 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cdkn2dQ60773 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdkn2dQ60773 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdkn2dQ60773 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdkn2dQ60773 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdkn2dQ60773 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdkn2dQ60773 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdkn2dQ60773 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdkn2dQ60773 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdkn2dQ60773 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdkn2dQ60773 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdkn2dQ60773 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdkn2dQ60773 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdkn2dQ60773 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdkn2dQ60773 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdkn2dQ60773 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdkn2dQ60773 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdkn2dQ60773 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdkn2dQ60773 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdkn2dQ60773 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdkn2dQ60773 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdkn2dQ60773 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdkn2dQ60773 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdkn2dQ60773 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdkn2dQ60773 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdkn2dQ60773 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdkn2dQ60773 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms