Protein–RNA interactions for Protein: Q60769

Tnfaip3, Tumor necrosis factor alpha-induced protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfaip3Q60769 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfaip3Q60769 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfaip3Q60769 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfaip3Q60769 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfaip3Q60769 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfaip3Q60769 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfaip3Q60769 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfaip3Q60769 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfaip3Q60769 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfaip3Q60769 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfaip3Q60769 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfaip3Q60769 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfaip3Q60769 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfaip3Q60769 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfaip3Q60769 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfaip3Q60769 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfaip3Q60769 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfaip3Q60769 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfaip3Q60769 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfaip3Q60769 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfaip3Q60769 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfaip3Q60769 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfaip3Q60769 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfaip3Q60769 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfaip3Q60769 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfaip3Q60769 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfaip3Q60769 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfaip3Q60769 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfaip3Q60769 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfaip3Q60769 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfaip3Q60769 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfaip3Q60769 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfaip3Q60769 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfaip3Q60769 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfaip3Q60769 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfaip3Q60769 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfaip3Q60769 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfaip3Q60769 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfaip3Q60769 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfaip3Q60769 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfaip3Q60769 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfaip3Q60769 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfaip3Q60769 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfaip3Q60769 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfaip3Q60769 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfaip3Q60769 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfaip3Q60769 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfaip3Q60769 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfaip3Q60769 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfaip3Q60769 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfaip3Q60769 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfaip3Q60769 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfaip3Q60769 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfaip3Q60769 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfaip3Q60769 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfaip3Q60769 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfaip3Q60769 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfaip3Q60769 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfaip3Q60769 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfaip3Q60769 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfaip3Q60769 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfaip3Q60769 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfaip3Q60769 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfaip3Q60769 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfaip3Q60769 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfaip3Q60769 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfaip3Q60769 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfaip3Q60769 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfaip3Q60769 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfaip3Q60769 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfaip3Q60769 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfaip3Q60769 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfaip3Q60769 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfaip3Q60769 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfaip3Q60769 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfaip3Q60769 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfaip3Q60769 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfaip3Q60769 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfaip3Q60769 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfaip3Q60769 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfaip3Q60769 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfaip3Q60769 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfaip3Q60769 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfaip3Q60769 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfaip3Q60769 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfaip3Q60769 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfaip3Q60769 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfaip3Q60769 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfaip3Q60769 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfaip3Q60769 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfaip3Q60769 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfaip3Q60769 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfaip3Q60769 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfaip3Q60769 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfaip3Q60769 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfaip3Q60769 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfaip3Q60769 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfaip3Q60769 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfaip3Q60769 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfaip3Q60769 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms