Protein–RNA interactions for Protein: Q60750

Epha1, Ephrin type-A receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha1Q60750 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Epha1Q60750 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Epha1Q60750 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Epha1Q60750 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Epha1Q60750 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Epha1Q60750 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Epha1Q60750 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Epha1Q60750 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Epha1Q60750 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Epha1Q60750 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Epha1Q60750 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Epha1Q60750 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Epha1Q60750 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Epha1Q60750 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Epha1Q60750 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Epha1Q60750 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Epha1Q60750 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Epha1Q60750 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Epha1Q60750 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Epha1Q60750 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Epha1Q60750 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Epha1Q60750 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Epha1Q60750 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Epha1Q60750 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Epha1Q60750 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Epha1Q60750 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Epha1Q60750 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Epha1Q60750 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Epha1Q60750 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Epha1Q60750 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Epha1Q60750 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Epha1Q60750 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Epha1Q60750 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Epha1Q60750 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Epha1Q60750 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Epha1Q60750 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Epha1Q60750 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Epha1Q60750 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Epha1Q60750 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Epha1Q60750 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Epha1Q60750 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Epha1Q60750 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Epha1Q60750 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Epha1Q60750 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Epha1Q60750 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Epha1Q60750 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Epha1Q60750 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Epha1Q60750 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Epha1Q60750 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Epha1Q60750 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Epha1Q60750 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Epha1Q60750 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Epha1Q60750 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Epha1Q60750 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Epha1Q60750 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Epha1Q60750 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Epha1Q60750 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Epha1Q60750 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Epha1Q60750 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Epha1Q60750 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Epha1Q60750 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Epha1Q60750 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Epha1Q60750 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Epha1Q60750 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Epha1Q60750 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Epha1Q60750 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Epha1Q60750 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Epha1Q60750 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Epha1Q60750 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Epha1Q60750 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Epha1Q60750 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Epha1Q60750 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Epha1Q60750 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Epha1Q60750 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Epha1Q60750 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Epha1Q60750 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Epha1Q60750 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Epha1Q60750 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Epha1Q60750 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Epha1Q60750 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Epha1Q60750 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Epha1Q60750 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Epha1Q60750 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Epha1Q60750 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Epha1Q60750 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Epha1Q60750 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Epha1Q60750 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Epha1Q60750 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Epha1Q60750 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Epha1Q60750 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Epha1Q60750 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Epha1Q60750 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Epha1Q60750 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Epha1Q60750 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Epha1Q60750 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Epha1Q60750 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Epha1Q60750 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Epha1Q60750 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Epha1Q60750 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Epha1Q60750 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms