Protein–RNA interactions for Protein: Q60519

Sema5b, Semaphorin-5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema5bQ60519 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sema5bQ60519 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sema5bQ60519 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sema5bQ60519 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sema5bQ60519 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sema5bQ60519 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sema5bQ60519 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sema5bQ60519 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sema5bQ60519 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sema5bQ60519 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sema5bQ60519 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sema5bQ60519 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sema5bQ60519 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sema5bQ60519 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sema5bQ60519 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sema5bQ60519 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sema5bQ60519 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sema5bQ60519 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sema5bQ60519 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Sema5bQ60519 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sema5bQ60519 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sema5bQ60519 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sema5bQ60519 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sema5bQ60519 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sema5bQ60519 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sema5bQ60519 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sema5bQ60519 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sema5bQ60519 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sema5bQ60519 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sema5bQ60519 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sema5bQ60519 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sema5bQ60519 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sema5bQ60519 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sema5bQ60519 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sema5bQ60519 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sema5bQ60519 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sema5bQ60519 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sema5bQ60519 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sema5bQ60519 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sema5bQ60519 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sema5bQ60519 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sema5bQ60519 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sema5bQ60519 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sema5bQ60519 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sema5bQ60519 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sema5bQ60519 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sema5bQ60519 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sema5bQ60519 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sema5bQ60519 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sema5bQ60519 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sema5bQ60519 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sema5bQ60519 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sema5bQ60519 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sema5bQ60519 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sema5bQ60519 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sema5bQ60519 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sema5bQ60519 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sema5bQ60519 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sema5bQ60519 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sema5bQ60519 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sema5bQ60519 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sema5bQ60519 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sema5bQ60519 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sema5bQ60519 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sema5bQ60519 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sema5bQ60519 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sema5bQ60519 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sema5bQ60519 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sema5bQ60519 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Sema5bQ60519 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sema5bQ60519 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sema5bQ60519 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Sema5bQ60519 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sema5bQ60519 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sema5bQ60519 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sema5bQ60519 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sema5bQ60519 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sema5bQ60519 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sema5bQ60519 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sema5bQ60519 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sema5bQ60519 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sema5bQ60519 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sema5bQ60519 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sema5bQ60519 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sema5bQ60519 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sema5bQ60519 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sema5bQ60519 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sema5bQ60519 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Sema5bQ60519 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sema5bQ60519 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sema5bQ60519 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sema5bQ60519 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sema5bQ60519 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sema5bQ60519 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sema5bQ60519 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sema5bQ60519 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sema5bQ60519 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sema5bQ60519 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Sema5bQ60519 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sema5bQ60519 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms