Protein–RNA interactions for Protein: Q5VCS6

Tdrd5, Tudor domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd5Q5VCS6 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Tdrd5Q5VCS6 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Tdrd5Q5VCS6 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tdrd5Q5VCS6 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tdrd5Q5VCS6 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tdrd5Q5VCS6 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tdrd5Q5VCS6 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tdrd5Q5VCS6 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tdrd5Q5VCS6 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tdrd5Q5VCS6 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tdrd5Q5VCS6 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tdrd5Q5VCS6 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tdrd5Q5VCS6 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tdrd5Q5VCS6 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tdrd5Q5VCS6 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tdrd5Q5VCS6 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tdrd5Q5VCS6 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tdrd5Q5VCS6 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tdrd5Q5VCS6 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Tdrd5Q5VCS6 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tdrd5Q5VCS6 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tdrd5Q5VCS6 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tdrd5Q5VCS6 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tdrd5Q5VCS6 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tdrd5Q5VCS6 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Tdrd5Q5VCS6 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Tdrd5Q5VCS6 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tdrd5Q5VCS6 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tdrd5Q5VCS6 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tdrd5Q5VCS6 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tdrd5Q5VCS6 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tdrd5Q5VCS6 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tdrd5Q5VCS6 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tdrd5Q5VCS6 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tdrd5Q5VCS6 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tdrd5Q5VCS6 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tdrd5Q5VCS6 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tdrd5Q5VCS6 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tdrd5Q5VCS6 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tdrd5Q5VCS6 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tdrd5Q5VCS6 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tdrd5Q5VCS6 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tdrd5Q5VCS6 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tdrd5Q5VCS6 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tdrd5Q5VCS6 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tdrd5Q5VCS6 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tdrd5Q5VCS6 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tdrd5Q5VCS6 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tdrd5Q5VCS6 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tdrd5Q5VCS6 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tdrd5Q5VCS6 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tdrd5Q5VCS6 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tdrd5Q5VCS6 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tdrd5Q5VCS6 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tdrd5Q5VCS6 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tdrd5Q5VCS6 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tdrd5Q5VCS6 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tdrd5Q5VCS6 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tdrd5Q5VCS6 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tdrd5Q5VCS6 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tdrd5Q5VCS6 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tdrd5Q5VCS6 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tdrd5Q5VCS6 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tdrd5Q5VCS6 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tdrd5Q5VCS6 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tdrd5Q5VCS6 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tdrd5Q5VCS6 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Tdrd5Q5VCS6 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tdrd5Q5VCS6 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tdrd5Q5VCS6 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tdrd5Q5VCS6 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tdrd5Q5VCS6 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tdrd5Q5VCS6 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tdrd5Q5VCS6 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tdrd5Q5VCS6 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tdrd5Q5VCS6 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tdrd5Q5VCS6 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tdrd5Q5VCS6 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tdrd5Q5VCS6 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tdrd5Q5VCS6 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tdrd5Q5VCS6 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tdrd5Q5VCS6 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tdrd5Q5VCS6 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tdrd5Q5VCS6 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tdrd5Q5VCS6 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tdrd5Q5VCS6 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tdrd5Q5VCS6 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Tdrd5Q5VCS6 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tdrd5Q5VCS6 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tdrd5Q5VCS6 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tdrd5Q5VCS6 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Tdrd5Q5VCS6 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tdrd5Q5VCS6 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tdrd5Q5VCS6 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tdrd5Q5VCS6 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tdrd5Q5VCS6 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tdrd5Q5VCS6 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tdrd5Q5VCS6 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tdrd5Q5VCS6 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tdrd5Q5VCS6 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms