Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4C3

Scaf1, Splicing factor, arginine/serine-rich 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf1Q5U4C3 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Scaf1Q5U4C3 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Scaf1Q5U4C3 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Scaf1Q5U4C3 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Scaf1Q5U4C3 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Scaf1Q5U4C3 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Scaf1Q5U4C3 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Scaf1Q5U4C3 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Scaf1Q5U4C3 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Scaf1Q5U4C3 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Scaf1Q5U4C3 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Scaf1Q5U4C3 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Scaf1Q5U4C3 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Scaf1Q5U4C3 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Scaf1Q5U4C3 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Scaf1Q5U4C3 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Scaf1Q5U4C3 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Scaf1Q5U4C3 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Scaf1Q5U4C3 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Scaf1Q5U4C3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Scaf1Q5U4C3 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Scaf1Q5U4C3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Scaf1Q5U4C3 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Scaf1Q5U4C3 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Scaf1Q5U4C3 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Scaf1Q5U4C3 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Scaf1Q5U4C3 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Scaf1Q5U4C3 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Scaf1Q5U4C3 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Scaf1Q5U4C3 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Scaf1Q5U4C3 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Scaf1Q5U4C3 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Scaf1Q5U4C3 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Scaf1Q5U4C3 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Scaf1Q5U4C3 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Scaf1Q5U4C3 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Scaf1Q5U4C3 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Scaf1Q5U4C3 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Scaf1Q5U4C3 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Scaf1Q5U4C3 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Scaf1Q5U4C3 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Scaf1Q5U4C3 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Scaf1Q5U4C3 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Scaf1Q5U4C3 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Scaf1Q5U4C3 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Scaf1Q5U4C3 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Scaf1Q5U4C3 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Scaf1Q5U4C3 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Scaf1Q5U4C3 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Scaf1Q5U4C3 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Scaf1Q5U4C3 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Scaf1Q5U4C3 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Scaf1Q5U4C3 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Scaf1Q5U4C3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Scaf1Q5U4C3 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Scaf1Q5U4C3 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Scaf1Q5U4C3 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Scaf1Q5U4C3 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Scaf1Q5U4C3 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Scaf1Q5U4C3 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Scaf1Q5U4C3 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Scaf1Q5U4C3 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Scaf1Q5U4C3 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Scaf1Q5U4C3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Scaf1Q5U4C3 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Scaf1Q5U4C3 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Scaf1Q5U4C3 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Scaf1Q5U4C3 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Scaf1Q5U4C3 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Scaf1Q5U4C3 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Scaf1Q5U4C3 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Scaf1Q5U4C3 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Scaf1Q5U4C3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Scaf1Q5U4C3 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Scaf1Q5U4C3 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Scaf1Q5U4C3 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Scaf1Q5U4C3 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Scaf1Q5U4C3 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Scaf1Q5U4C3 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Scaf1Q5U4C3 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Scaf1Q5U4C3 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Scaf1Q5U4C3 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Scaf1Q5U4C3 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Scaf1Q5U4C3 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Scaf1Q5U4C3 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Scaf1Q5U4C3 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Scaf1Q5U4C3 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Scaf1Q5U4C3 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Scaf1Q5U4C3 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Scaf1Q5U4C3 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Scaf1Q5U4C3 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Scaf1Q5U4C3 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Scaf1Q5U4C3 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Scaf1Q5U4C3 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Scaf1Q5U4C3 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Scaf1Q5U4C3 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Scaf1Q5U4C3 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Scaf1Q5U4C3 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Scaf1Q5U4C3 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Scaf1Q5U4C3 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms