Protein–RNA interactions for Protein: Q5U465

Ccdc125, Coiled-coil domain-containing protein 125, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc125Q5U465 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc125Q5U465 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc125Q5U465 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc125Q5U465 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc125Q5U465 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc125Q5U465 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc125Q5U465 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc125Q5U465 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc125Q5U465 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc125Q5U465 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc125Q5U465 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc125Q5U465 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc125Q5U465 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc125Q5U465 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc125Q5U465 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc125Q5U465 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc125Q5U465 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc125Q5U465 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc125Q5U465 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc125Q5U465 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc125Q5U465 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc125Q5U465 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc125Q5U465 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc125Q5U465 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc125Q5U465 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc125Q5U465 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc125Q5U465 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc125Q5U465 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc125Q5U465 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc125Q5U465 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc125Q5U465 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc125Q5U465 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Ccdc125Q5U465 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Ccdc125Q5U465 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc125Q5U465 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc125Q5U465 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc125Q5U465 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc125Q5U465 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc125Q5U465 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc125Q5U465 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc125Q5U465 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc125Q5U465 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc125Q5U465 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc125Q5U465 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc125Q5U465 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc125Q5U465 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc125Q5U465 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc125Q5U465 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc125Q5U465 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc125Q5U465 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc125Q5U465 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc125Q5U465 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc125Q5U465 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc125Q5U465 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc125Q5U465 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc125Q5U465 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc125Q5U465 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc125Q5U465 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc125Q5U465 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc125Q5U465 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc125Q5U465 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc125Q5U465 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc125Q5U465 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc125Q5U465 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc125Q5U465 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc125Q5U465 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc125Q5U465 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc125Q5U465 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc125Q5U465 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc125Q5U465 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc125Q5U465 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc125Q5U465 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc125Q5U465 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc125Q5U465 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc125Q5U465 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc125Q5U465 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc125Q5U465 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc125Q5U465 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc125Q5U465 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc125Q5U465 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc125Q5U465 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc125Q5U465 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc125Q5U465 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc125Q5U465 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc125Q5U465 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc125Q5U465 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc125Q5U465 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc125Q5U465 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc125Q5U465 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc125Q5U465 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc125Q5U465 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc125Q5U465 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc125Q5U465 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc125Q5U465 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc125Q5U465 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc125Q5U465 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc125Q5U465 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc125Q5U465 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc125Q5U465 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc125Q5U465 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms