Protein–RNA interactions for Protein: Q5U3K5

Rabl6, Rab-like protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabl6Q5U3K5 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Rabl6Q5U3K5 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Rabl6Q5U3K5 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rabl6Q5U3K5 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rabl6Q5U3K5 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rabl6Q5U3K5 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rabl6Q5U3K5 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rabl6Q5U3K5 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rabl6Q5U3K5 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rabl6Q5U3K5 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rabl6Q5U3K5 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rabl6Q5U3K5 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rabl6Q5U3K5 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rabl6Q5U3K5 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rabl6Q5U3K5 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rabl6Q5U3K5 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rabl6Q5U3K5 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rabl6Q5U3K5 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rabl6Q5U3K5 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rabl6Q5U3K5 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rabl6Q5U3K5 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rabl6Q5U3K5 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rabl6Q5U3K5 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rabl6Q5U3K5 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Rabl6Q5U3K5 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rabl6Q5U3K5 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rabl6Q5U3K5 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rabl6Q5U3K5 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rabl6Q5U3K5 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rabl6Q5U3K5 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rabl6Q5U3K5 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Rabl6Q5U3K5 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rabl6Q5U3K5 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rabl6Q5U3K5 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rabl6Q5U3K5 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rabl6Q5U3K5 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rabl6Q5U3K5 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rabl6Q5U3K5 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rabl6Q5U3K5 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rabl6Q5U3K5 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rabl6Q5U3K5 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rabl6Q5U3K5 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rabl6Q5U3K5 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rabl6Q5U3K5 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Rabl6Q5U3K5 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rabl6Q5U3K5 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rabl6Q5U3K5 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rabl6Q5U3K5 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rabl6Q5U3K5 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rabl6Q5U3K5 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rabl6Q5U3K5 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rabl6Q5U3K5 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rabl6Q5U3K5 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rabl6Q5U3K5 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Rabl6Q5U3K5 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rabl6Q5U3K5 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rabl6Q5U3K5 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rabl6Q5U3K5 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rabl6Q5U3K5 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rabl6Q5U3K5 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rabl6Q5U3K5 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rabl6Q5U3K5 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rabl6Q5U3K5 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rabl6Q5U3K5 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rabl6Q5U3K5 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rabl6Q5U3K5 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Rabl6Q5U3K5 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rabl6Q5U3K5 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rabl6Q5U3K5 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rabl6Q5U3K5 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rabl6Q5U3K5 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rabl6Q5U3K5 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rabl6Q5U3K5 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rabl6Q5U3K5 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rabl6Q5U3K5 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rabl6Q5U3K5 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Rabl6Q5U3K5 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rabl6Q5U3K5 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Rabl6Q5U3K5 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rabl6Q5U3K5 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rabl6Q5U3K5 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rabl6Q5U3K5 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rabl6Q5U3K5 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rabl6Q5U3K5 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rabl6Q5U3K5 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rabl6Q5U3K5 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rabl6Q5U3K5 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rabl6Q5U3K5 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rabl6Q5U3K5 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rabl6Q5U3K5 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rabl6Q5U3K5 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rabl6Q5U3K5 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rabl6Q5U3K5 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rabl6Q5U3K5 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rabl6Q5U3K5 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rabl6Q5U3K5 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rabl6Q5U3K5 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rabl6Q5U3K5 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rabl6Q5U3K5 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rabl6Q5U3K5 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms