Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXJ3

Brip1, Fanconi anemia group J protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brip1Q5SXJ3 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Brip1Q5SXJ3 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Brip1Q5SXJ3 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Brip1Q5SXJ3 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Brip1Q5SXJ3 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Brip1Q5SXJ3 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Brip1Q5SXJ3 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Brip1Q5SXJ3 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Brip1Q5SXJ3 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Brip1Q5SXJ3 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Brip1Q5SXJ3 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Brip1Q5SXJ3 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Brip1Q5SXJ3 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Brip1Q5SXJ3 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Brip1Q5SXJ3 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Brip1Q5SXJ3 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Brip1Q5SXJ3 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Brip1Q5SXJ3 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Brip1Q5SXJ3 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Brip1Q5SXJ3 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Brip1Q5SXJ3 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Brip1Q5SXJ3 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Brip1Q5SXJ3 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Brip1Q5SXJ3 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Brip1Q5SXJ3 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Brip1Q5SXJ3 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Brip1Q5SXJ3 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Brip1Q5SXJ3 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Brip1Q5SXJ3 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Brip1Q5SXJ3 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Brip1Q5SXJ3 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Brip1Q5SXJ3 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Brip1Q5SXJ3 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Brip1Q5SXJ3 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Brip1Q5SXJ3 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Brip1Q5SXJ3 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Brip1Q5SXJ3 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Brip1Q5SXJ3 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Brip1Q5SXJ3 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Brip1Q5SXJ3 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Brip1Q5SXJ3 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Brip1Q5SXJ3 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Brip1Q5SXJ3 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Brip1Q5SXJ3 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Brip1Q5SXJ3 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Brip1Q5SXJ3 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Brip1Q5SXJ3 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Brip1Q5SXJ3 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Brip1Q5SXJ3 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Brip1Q5SXJ3 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Brip1Q5SXJ3 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Brip1Q5SXJ3 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Brip1Q5SXJ3 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Brip1Q5SXJ3 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Brip1Q5SXJ3 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Brip1Q5SXJ3 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Brip1Q5SXJ3 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Brip1Q5SXJ3 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Brip1Q5SXJ3 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Brip1Q5SXJ3 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Brip1Q5SXJ3 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Brip1Q5SXJ3 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Brip1Q5SXJ3 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Brip1Q5SXJ3 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Brip1Q5SXJ3 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Brip1Q5SXJ3 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Brip1Q5SXJ3 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Brip1Q5SXJ3 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Brip1Q5SXJ3 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Brip1Q5SXJ3 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Brip1Q5SXJ3 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Brip1Q5SXJ3 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Brip1Q5SXJ3 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Brip1Q5SXJ3 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Brip1Q5SXJ3 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Brip1Q5SXJ3 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Brip1Q5SXJ3 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Brip1Q5SXJ3 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Brip1Q5SXJ3 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Brip1Q5SXJ3 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Brip1Q5SXJ3 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Brip1Q5SXJ3 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Brip1Q5SXJ3 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Brip1Q5SXJ3 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Brip1Q5SXJ3 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Brip1Q5SXJ3 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Brip1Q5SXJ3 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Brip1Q5SXJ3 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Brip1Q5SXJ3 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Brip1Q5SXJ3 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Brip1Q5SXJ3 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Brip1Q5SXJ3 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Brip1Q5SXJ3 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Brip1Q5SXJ3 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Brip1Q5SXJ3 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Brip1Q5SXJ3 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Brip1Q5SXJ3 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Brip1Q5SXJ3 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Brip1Q5SXJ3 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Brip1Q5SXJ3 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms