Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tsr1Q5SWD9 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tsr1Q5SWD9 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tsr1Q5SWD9 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tsr1Q5SWD9 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tsr1Q5SWD9 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tsr1Q5SWD9 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tsr1Q5SWD9 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tsr1Q5SWD9 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tsr1Q5SWD9 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tsr1Q5SWD9 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tsr1Q5SWD9 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tsr1Q5SWD9 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tsr1Q5SWD9 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tsr1Q5SWD9 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tsr1Q5SWD9 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tsr1Q5SWD9 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tsr1Q5SWD9 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tsr1Q5SWD9 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tsr1Q5SWD9 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tsr1Q5SWD9 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tsr1Q5SWD9 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tsr1Q5SWD9 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tsr1Q5SWD9 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tsr1Q5SWD9 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tsr1Q5SWD9 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tsr1Q5SWD9 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tsr1Q5SWD9 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tsr1Q5SWD9 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tsr1Q5SWD9 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tsr1Q5SWD9 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tsr1Q5SWD9 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tsr1Q5SWD9 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tsr1Q5SWD9 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Tsr1Q5SWD9 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tsr1Q5SWD9 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tsr1Q5SWD9 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tsr1Q5SWD9 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tsr1Q5SWD9 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tsr1Q5SWD9 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tsr1Q5SWD9 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tsr1Q5SWD9 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tsr1Q5SWD9 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tsr1Q5SWD9 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tsr1Q5SWD9 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tsr1Q5SWD9 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tsr1Q5SWD9 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tsr1Q5SWD9 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tsr1Q5SWD9 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tsr1Q5SWD9 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tsr1Q5SWD9 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Tsr1Q5SWD9 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Tsr1Q5SWD9 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tsr1Q5SWD9 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tsr1Q5SWD9 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tsr1Q5SWD9 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tsr1Q5SWD9 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tsr1Q5SWD9 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tsr1Q5SWD9 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tsr1Q5SWD9 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tsr1Q5SWD9 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tsr1Q5SWD9 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tsr1Q5SWD9 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tsr1Q5SWD9 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tsr1Q5SWD9 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Tsr1Q5SWD9 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tsr1Q5SWD9 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tsr1Q5SWD9 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tsr1Q5SWD9 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tsr1Q5SWD9 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tsr1Q5SWD9 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tsr1Q5SWD9 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tsr1Q5SWD9 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tsr1Q5SWD9 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tsr1Q5SWD9 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tsr1Q5SWD9 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tsr1Q5SWD9 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tsr1Q5SWD9 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tsr1Q5SWD9 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tsr1Q5SWD9 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tsr1Q5SWD9 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tsr1Q5SWD9 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tsr1Q5SWD9 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tsr1Q5SWD9 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tsr1Q5SWD9 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tsr1Q5SWD9 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tsr1Q5SWD9 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tsr1Q5SWD9 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tsr1Q5SWD9 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tsr1Q5SWD9 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tsr1Q5SWD9 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tsr1Q5SWD9 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tsr1Q5SWD9 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tsr1Q5SWD9 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Tsr1Q5SWD9 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tsr1Q5SWD9 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tsr1Q5SWD9 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tsr1Q5SWD9 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tsr1Q5SWD9 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tsr1Q5SWD9 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms