Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUD9

Bbs12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbs12Q5SUD9 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bbs12Q5SUD9 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bbs12Q5SUD9 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bbs12Q5SUD9 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bbs12Q5SUD9 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bbs12Q5SUD9 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bbs12Q5SUD9 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bbs12Q5SUD9 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bbs12Q5SUD9 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bbs12Q5SUD9 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bbs12Q5SUD9 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bbs12Q5SUD9 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bbs12Q5SUD9 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Bbs12Q5SUD9 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bbs12Q5SUD9 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bbs12Q5SUD9 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Bbs12Q5SUD9 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bbs12Q5SUD9 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bbs12Q5SUD9 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bbs12Q5SUD9 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bbs12Q5SUD9 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bbs12Q5SUD9 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bbs12Q5SUD9 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bbs12Q5SUD9 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bbs12Q5SUD9 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bbs12Q5SUD9 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bbs12Q5SUD9 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bbs12Q5SUD9 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bbs12Q5SUD9 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bbs12Q5SUD9 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bbs12Q5SUD9 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bbs12Q5SUD9 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bbs12Q5SUD9 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bbs12Q5SUD9 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bbs12Q5SUD9 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Bbs12Q5SUD9 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bbs12Q5SUD9 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bbs12Q5SUD9 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bbs12Q5SUD9 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bbs12Q5SUD9 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bbs12Q5SUD9 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bbs12Q5SUD9 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bbs12Q5SUD9 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bbs12Q5SUD9 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bbs12Q5SUD9 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bbs12Q5SUD9 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bbs12Q5SUD9 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bbs12Q5SUD9 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bbs12Q5SUD9 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bbs12Q5SUD9 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bbs12Q5SUD9 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bbs12Q5SUD9 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bbs12Q5SUD9 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bbs12Q5SUD9 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bbs12Q5SUD9 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bbs12Q5SUD9 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bbs12Q5SUD9 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bbs12Q5SUD9 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bbs12Q5SUD9 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bbs12Q5SUD9 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bbs12Q5SUD9 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bbs12Q5SUD9 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bbs12Q5SUD9 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bbs12Q5SUD9 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bbs12Q5SUD9 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bbs12Q5SUD9 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bbs12Q5SUD9 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bbs12Q5SUD9 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bbs12Q5SUD9 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bbs12Q5SUD9 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bbs12Q5SUD9 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bbs12Q5SUD9 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bbs12Q5SUD9 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bbs12Q5SUD9 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bbs12Q5SUD9 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bbs12Q5SUD9 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bbs12Q5SUD9 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bbs12Q5SUD9 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bbs12Q5SUD9 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bbs12Q5SUD9 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bbs12Q5SUD9 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Bbs12Q5SUD9 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Bbs12Q5SUD9 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bbs12Q5SUD9 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bbs12Q5SUD9 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bbs12Q5SUD9 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bbs12Q5SUD9 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bbs12Q5SUD9 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bbs12Q5SUD9 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bbs12Q5SUD9 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bbs12Q5SUD9 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bbs12Q5SUD9 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bbs12Q5SUD9 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bbs12Q5SUD9 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bbs12Q5SUD9 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bbs12Q5SUD9 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bbs12Q5SUD9 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bbs12Q5SUD9 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bbs12Q5SUD9 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bbs12Q5SUD9 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.3 ms