Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSZ5

Tns3, Tensin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tns3Q5SSZ5 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tns3Q5SSZ5 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tns3Q5SSZ5 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tns3Q5SSZ5 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tns3Q5SSZ5 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Tns3Q5SSZ5 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tns3Q5SSZ5 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tns3Q5SSZ5 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tns3Q5SSZ5 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Tns3Q5SSZ5 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tns3Q5SSZ5 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tns3Q5SSZ5 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tns3Q5SSZ5 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tns3Q5SSZ5 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tns3Q5SSZ5 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Tns3Q5SSZ5 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tns3Q5SSZ5 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tns3Q5SSZ5 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tns3Q5SSZ5 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Tns3Q5SSZ5 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tns3Q5SSZ5 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tns3Q5SSZ5 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tns3Q5SSZ5 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tns3Q5SSZ5 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tns3Q5SSZ5 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tns3Q5SSZ5 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tns3Q5SSZ5 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tns3Q5SSZ5 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Tns3Q5SSZ5 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Tns3Q5SSZ5 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tns3Q5SSZ5 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Tns3Q5SSZ5 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tns3Q5SSZ5 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tns3Q5SSZ5 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tns3Q5SSZ5 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tns3Q5SSZ5 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tns3Q5SSZ5 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tns3Q5SSZ5 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tns3Q5SSZ5 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Tns3Q5SSZ5 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tns3Q5SSZ5 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tns3Q5SSZ5 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tns3Q5SSZ5 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tns3Q5SSZ5 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tns3Q5SSZ5 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tns3Q5SSZ5 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tns3Q5SSZ5 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tns3Q5SSZ5 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tns3Q5SSZ5 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tns3Q5SSZ5 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Tns3Q5SSZ5 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tns3Q5SSZ5 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Tns3Q5SSZ5 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Tns3Q5SSZ5 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tns3Q5SSZ5 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tns3Q5SSZ5 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Tns3Q5SSZ5 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tns3Q5SSZ5 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tns3Q5SSZ5 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tns3Q5SSZ5 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Tns3Q5SSZ5 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tns3Q5SSZ5 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tns3Q5SSZ5 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC23.02■■□□□ 1.27
Tns3Q5SSZ5 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Tns3Q5SSZ5 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tns3Q5SSZ5 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tns3Q5SSZ5 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tns3Q5SSZ5 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tns3Q5SSZ5 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tns3Q5SSZ5 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tns3Q5SSZ5 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tns3Q5SSZ5 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tns3Q5SSZ5 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tns3Q5SSZ5 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Tns3Q5SSZ5 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tns3Q5SSZ5 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tns3Q5SSZ5 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tns3Q5SSZ5 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tns3Q5SSZ5 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tns3Q5SSZ5 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tns3Q5SSZ5 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tns3Q5SSZ5 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Tns3Q5SSZ5 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Tns3Q5SSZ5 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Tns3Q5SSZ5 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tns3Q5SSZ5 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Tns3Q5SSZ5 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Tns3Q5SSZ5 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Tns3Q5SSZ5 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tns3Q5SSZ5 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tns3Q5SSZ5 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tns3Q5SSZ5 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tns3Q5SSZ5 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Tns3Q5SSZ5 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Tns3Q5SSZ5 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tns3Q5SSZ5 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tns3Q5SSZ5 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Tns3Q5SSZ5 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tns3Q5SSZ5 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tns3Q5SSZ5 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms