Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Utp18Q5SSI6 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Utp18Q5SSI6 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Utp18Q5SSI6 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Utp18Q5SSI6 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Utp18Q5SSI6 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Utp18Q5SSI6 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Utp18Q5SSI6 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Utp18Q5SSI6 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Utp18Q5SSI6 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Utp18Q5SSI6 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Utp18Q5SSI6 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Utp18Q5SSI6 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Utp18Q5SSI6 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Utp18Q5SSI6 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Utp18Q5SSI6 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Utp18Q5SSI6 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Utp18Q5SSI6 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Utp18Q5SSI6 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Utp18Q5SSI6 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Utp18Q5SSI6 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Utp18Q5SSI6 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Utp18Q5SSI6 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Utp18Q5SSI6 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Utp18Q5SSI6 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Utp18Q5SSI6 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Utp18Q5SSI6 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Utp18Q5SSI6 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Utp18Q5SSI6 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Utp18Q5SSI6 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Utp18Q5SSI6 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Utp18Q5SSI6 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Utp18Q5SSI6 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Utp18Q5SSI6 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Utp18Q5SSI6 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Utp18Q5SSI6 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Utp18Q5SSI6 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Utp18Q5SSI6 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Utp18Q5SSI6 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Utp18Q5SSI6 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Utp18Q5SSI6 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Utp18Q5SSI6 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Utp18Q5SSI6 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Utp18Q5SSI6 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Utp18Q5SSI6 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Utp18Q5SSI6 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Utp18Q5SSI6 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Utp18Q5SSI6 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Utp18Q5SSI6 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Utp18Q5SSI6 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Utp18Q5SSI6 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Utp18Q5SSI6 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Utp18Q5SSI6 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Utp18Q5SSI6 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Utp18Q5SSI6 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Utp18Q5SSI6 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Utp18Q5SSI6 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Utp18Q5SSI6 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Utp18Q5SSI6 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Utp18Q5SSI6 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Utp18Q5SSI6 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Utp18Q5SSI6 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Utp18Q5SSI6 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Utp18Q5SSI6 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Utp18Q5SSI6 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Utp18Q5SSI6 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Utp18Q5SSI6 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Utp18Q5SSI6 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Utp18Q5SSI6 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Utp18Q5SSI6 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Utp18Q5SSI6 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Utp18Q5SSI6 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Utp18Q5SSI6 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Utp18Q5SSI6 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Utp18Q5SSI6 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Utp18Q5SSI6 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Utp18Q5SSI6 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Utp18Q5SSI6 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Utp18Q5SSI6 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Utp18Q5SSI6 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Utp18Q5SSI6 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Utp18Q5SSI6 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Utp18Q5SSI6 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Utp18Q5SSI6 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Utp18Q5SSI6 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Utp18Q5SSI6 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Utp18Q5SSI6 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Utp18Q5SSI6 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Utp18Q5SSI6 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Utp18Q5SSI6 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Utp18Q5SSI6 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Utp18Q5SSI6 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Utp18Q5SSI6 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Utp18Q5SSI6 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Utp18Q5SSI6 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Utp18Q5SSI6 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Utp18Q5SSI6 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Utp18Q5SSI6 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Utp18Q5SSI6 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Utp18Q5SSI6 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms