Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC48

Gm12253, Predicted gene 12253, mousemouse

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Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm12253Q5NC48 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Gm12253Q5NC48 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm12253Q5NC48 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm12253Q5NC48 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm12253Q5NC48 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm12253Q5NC48 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm12253Q5NC48 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm12253Q5NC48 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm12253Q5NC48 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Gm12253Q5NC48 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm12253Q5NC48 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm12253Q5NC48 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm12253Q5NC48 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm12253Q5NC48 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm12253Q5NC48 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm12253Q5NC48 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm12253Q5NC48 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm12253Q5NC48 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm12253Q5NC48 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Gm12253Q5NC48 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm12253Q5NC48 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Gm12253Q5NC48 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm12253Q5NC48 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm12253Q5NC48 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm12253Q5NC48 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Gm12253Q5NC48 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Gm12253Q5NC48 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm12253Q5NC48 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Gm12253Q5NC48 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm12253Q5NC48 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Gm12253Q5NC48 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm12253Q5NC48 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm12253Q5NC48 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Gm12253Q5NC48 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm12253Q5NC48 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm12253Q5NC48 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm12253Q5NC48 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm12253Q5NC48 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm12253Q5NC48 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm12253Q5NC48 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm12253Q5NC48 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm12253Q5NC48 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm12253Q5NC48 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm12253Q5NC48 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm12253Q5NC48 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm12253Q5NC48 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm12253Q5NC48 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm12253Q5NC48 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm12253Q5NC48 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm12253Q5NC48 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm12253Q5NC48 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm12253Q5NC48 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm12253Q5NC48 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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