Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC41

1810065E05Rik, RIKEN cDNA 1810065E05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1810065E05RikQ5NC41 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
1810065E05RikQ5NC41 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
1810065E05RikQ5NC41 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
1810065E05RikQ5NC41 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
1810065E05RikQ5NC41 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
1810065E05RikQ5NC41 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
1810065E05RikQ5NC41 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
1810065E05RikQ5NC41 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
1810065E05RikQ5NC41 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
1810065E05RikQ5NC41 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
1810065E05RikQ5NC41 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
1810065E05RikQ5NC41 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
1810065E05RikQ5NC41 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
1810065E05RikQ5NC41 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
1810065E05RikQ5NC41 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
1810065E05RikQ5NC41 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
1810065E05RikQ5NC41 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
1810065E05RikQ5NC41 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
1810065E05RikQ5NC41 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
1810065E05RikQ5NC41 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
1810065E05RikQ5NC41 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
1810065E05RikQ5NC41 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
1810065E05RikQ5NC41 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
1810065E05RikQ5NC41 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
1810065E05RikQ5NC41 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
1810065E05RikQ5NC41 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
1810065E05RikQ5NC41 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
1810065E05RikQ5NC41 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
1810065E05RikQ5NC41 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
1810065E05RikQ5NC41 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
1810065E05RikQ5NC41 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
1810065E05RikQ5NC41 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
1810065E05RikQ5NC41 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
1810065E05RikQ5NC41 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
1810065E05RikQ5NC41 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
1810065E05RikQ5NC41 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
1810065E05RikQ5NC41 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
1810065E05RikQ5NC41 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
1810065E05RikQ5NC41 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
1810065E05RikQ5NC41 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
1810065E05RikQ5NC41 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
1810065E05RikQ5NC41 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
1810065E05RikQ5NC41 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
1810065E05RikQ5NC41 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
1810065E05RikQ5NC41 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
1810065E05RikQ5NC41 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
1810065E05RikQ5NC41 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
1810065E05RikQ5NC41 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
1810065E05RikQ5NC41 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
1810065E05RikQ5NC41 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
1810065E05RikQ5NC41 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
1810065E05RikQ5NC41 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
1810065E05RikQ5NC41 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
1810065E05RikQ5NC41 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
1810065E05RikQ5NC41 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
1810065E05RikQ5NC41 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
1810065E05RikQ5NC41 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
1810065E05RikQ5NC41 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
1810065E05RikQ5NC41 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
1810065E05RikQ5NC41 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
1810065E05RikQ5NC41 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
1810065E05RikQ5NC41 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
1810065E05RikQ5NC41 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
1810065E05RikQ5NC41 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
1810065E05RikQ5NC41 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
1810065E05RikQ5NC41 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
1810065E05RikQ5NC41 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
1810065E05RikQ5NC41 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
1810065E05RikQ5NC41 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
1810065E05RikQ5NC41 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
1810065E05RikQ5NC41 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
1810065E05RikQ5NC41 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
1810065E05RikQ5NC41 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
1810065E05RikQ5NC41 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
1810065E05RikQ5NC41 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
1810065E05RikQ5NC41 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
1810065E05RikQ5NC41 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
1810065E05RikQ5NC41 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
1810065E05RikQ5NC41 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
1810065E05RikQ5NC41 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
1810065E05RikQ5NC41 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
1810065E05RikQ5NC41 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
1810065E05RikQ5NC41 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
1810065E05RikQ5NC41 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
1810065E05RikQ5NC41 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
1810065E05RikQ5NC41 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
1810065E05RikQ5NC41 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
1810065E05RikQ5NC41 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
1810065E05RikQ5NC41 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
1810065E05RikQ5NC41 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
1810065E05RikQ5NC41 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
1810065E05RikQ5NC41 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
1810065E05RikQ5NC41 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
1810065E05RikQ5NC41 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
1810065E05RikQ5NC41 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
1810065E05RikQ5NC41 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
1810065E05RikQ5NC41 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
1810065E05RikQ5NC41 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
1810065E05RikQ5NC41 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
1810065E05RikQ5NC41 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms