Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC05

Ttf2, Transcription termination factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf2Q5NC05 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ttf2Q5NC05 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ttf2Q5NC05 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ttf2Q5NC05 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ttf2Q5NC05 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ttf2Q5NC05 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ttf2Q5NC05 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ttf2Q5NC05 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ttf2Q5NC05 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ttf2Q5NC05 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ttf2Q5NC05 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ttf2Q5NC05 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Ttf2Q5NC05 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttf2Q5NC05 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttf2Q5NC05 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttf2Q5NC05 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttf2Q5NC05 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttf2Q5NC05 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttf2Q5NC05 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttf2Q5NC05 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttf2Q5NC05 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttf2Q5NC05 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttf2Q5NC05 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttf2Q5NC05 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttf2Q5NC05 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttf2Q5NC05 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttf2Q5NC05 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttf2Q5NC05 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttf2Q5NC05 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttf2Q5NC05 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttf2Q5NC05 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttf2Q5NC05 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttf2Q5NC05 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttf2Q5NC05 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttf2Q5NC05 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttf2Q5NC05 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttf2Q5NC05 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttf2Q5NC05 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttf2Q5NC05 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttf2Q5NC05 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttf2Q5NC05 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttf2Q5NC05 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttf2Q5NC05 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttf2Q5NC05 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttf2Q5NC05 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttf2Q5NC05 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttf2Q5NC05 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttf2Q5NC05 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttf2Q5NC05 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttf2Q5NC05 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttf2Q5NC05 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ttf2Q5NC05 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ttf2Q5NC05 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ttf2Q5NC05 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ttf2Q5NC05 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ttf2Q5NC05 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ttf2Q5NC05 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ttf2Q5NC05 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ttf2Q5NC05 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ttf2Q5NC05 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ttf2Q5NC05 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ttf2Q5NC05 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ttf2Q5NC05 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ttf2Q5NC05 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttf2Q5NC05 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttf2Q5NC05 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttf2Q5NC05 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttf2Q5NC05 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttf2Q5NC05 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttf2Q5NC05 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttf2Q5NC05 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttf2Q5NC05 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttf2Q5NC05 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttf2Q5NC05 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttf2Q5NC05 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttf2Q5NC05 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttf2Q5NC05 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttf2Q5NC05 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttf2Q5NC05 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttf2Q5NC05 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttf2Q5NC05 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttf2Q5NC05 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttf2Q5NC05 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttf2Q5NC05 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttf2Q5NC05 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttf2Q5NC05 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttf2Q5NC05 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttf2Q5NC05 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttf2Q5NC05 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttf2Q5NC05 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttf2Q5NC05 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttf2Q5NC05 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttf2Q5NC05 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttf2Q5NC05 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttf2Q5NC05 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttf2Q5NC05 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttf2Q5NC05 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttf2Q5NC05 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttf2Q5NC05 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttf2Q5NC05 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms