Protein–RNA interactions for Protein: Q5FWC9

Gm3558, Predicted gene 3558, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3558Q5FWC9 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
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Gm3558Q5FWC9 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3558Q5FWC9 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm3558Q5FWC9 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm3558Q5FWC9 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm3558Q5FWC9 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm3558Q5FWC9 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm3558Q5FWC9 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm3558Q5FWC9 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm3558Q5FWC9 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm3558Q5FWC9 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm3558Q5FWC9 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3558Q5FWC9 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3558Q5FWC9 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3558Q5FWC9 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3558Q5FWC9 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3558Q5FWC9 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3558Q5FWC9 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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Gm3558Q5FWC9 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
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Gm3558Q5FWC9 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
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Gm3558Q5FWC9 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3558Q5FWC9 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3558Q5FWC9 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Gm3558Q5FWC9 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Gm3558Q5FWC9 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Gm3558Q5FWC9 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3558Q5FWC9 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3558Q5FWC9 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3558Q5FWC9 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
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Gm3558Q5FWC9 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Gm3558Q5FWC9 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Gm3558Q5FWC9 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Gm3558Q5FWC9 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Gm3558Q5FWC9 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3558Q5FWC9 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Gm3558Q5FWC9 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Gm3558Q5FWC9 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3558Q5FWC9 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3558Q5FWC9 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3558Q5FWC9 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3558Q5FWC9 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3558Q5FWC9 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3558Q5FWC9 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
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Gm3558Q5FWC9 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3558Q5FWC9 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3558Q5FWC9 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3558Q5FWC9 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3558Q5FWC9 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3558Q5FWC9 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3558Q5FWC9 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3558Q5FWC9 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3558Q5FWC9 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3558Q5FWC9 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3558Q5FWC9 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3558Q5FWC9 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3558Q5FWC9 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3558Q5FWC9 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3558Q5FWC9 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3558Q5FWC9 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3558Q5FWC9 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3558Q5FWC9 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
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