Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU02

Usp22, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 22, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp22Q5DU02 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp22Q5DU02 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp22Q5DU02 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp22Q5DU02 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp22Q5DU02 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp22Q5DU02 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp22Q5DU02 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp22Q5DU02 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp22Q5DU02 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp22Q5DU02 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp22Q5DU02 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp22Q5DU02 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp22Q5DU02 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp22Q5DU02 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp22Q5DU02 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp22Q5DU02 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp22Q5DU02 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp22Q5DU02 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp22Q5DU02 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp22Q5DU02 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp22Q5DU02 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp22Q5DU02 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp22Q5DU02 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp22Q5DU02 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp22Q5DU02 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp22Q5DU02 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp22Q5DU02 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp22Q5DU02 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp22Q5DU02 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp22Q5DU02 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp22Q5DU02 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp22Q5DU02 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp22Q5DU02 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp22Q5DU02 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp22Q5DU02 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp22Q5DU02 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp22Q5DU02 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp22Q5DU02 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp22Q5DU02 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp22Q5DU02 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp22Q5DU02 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp22Q5DU02 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp22Q5DU02 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp22Q5DU02 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp22Q5DU02 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp22Q5DU02 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp22Q5DU02 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp22Q5DU02 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp22Q5DU02 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp22Q5DU02 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp22Q5DU02 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp22Q5DU02 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp22Q5DU02 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp22Q5DU02 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp22Q5DU02 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp22Q5DU02 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp22Q5DU02 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp22Q5DU02 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp22Q5DU02 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp22Q5DU02 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp22Q5DU02 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp22Q5DU02 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp22Q5DU02 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp22Q5DU02 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp22Q5DU02 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp22Q5DU02 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp22Q5DU02 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp22Q5DU02 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp22Q5DU02 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp22Q5DU02 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp22Q5DU02 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp22Q5DU02 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp22Q5DU02 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp22Q5DU02 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp22Q5DU02 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp22Q5DU02 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp22Q5DU02 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp22Q5DU02 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp22Q5DU02 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp22Q5DU02 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp22Q5DU02 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp22Q5DU02 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp22Q5DU02 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp22Q5DU02 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp22Q5DU02 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp22Q5DU02 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp22Q5DU02 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp22Q5DU02 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp22Q5DU02 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp22Q5DU02 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp22Q5DU02 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp22Q5DU02 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp22Q5DU02 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp22Q5DU02 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp22Q5DU02 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp22Q5DU02 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp22Q5DU02 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp22Q5DU02 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp22Q5DU02 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp22Q5DU02 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms