Protein–RNA interactions for Protein: Q59J78

Ndufaf2, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf2Q59J78 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ndufaf2Q59J78 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ndufaf2Q59J78 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ndufaf2Q59J78 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ndufaf2Q59J78 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ndufaf2Q59J78 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ndufaf2Q59J78 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ndufaf2Q59J78 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ndufaf2Q59J78 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ndufaf2Q59J78 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ndufaf2Q59J78 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ndufaf2Q59J78 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ndufaf2Q59J78 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ndufaf2Q59J78 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ndufaf2Q59J78 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ndufaf2Q59J78 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ndufaf2Q59J78 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ndufaf2Q59J78 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ndufaf2Q59J78 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ndufaf2Q59J78 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ndufaf2Q59J78 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ndufaf2Q59J78 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ndufaf2Q59J78 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ndufaf2Q59J78 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ndufaf2Q59J78 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ndufaf2Q59J78 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ndufaf2Q59J78 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ndufaf2Q59J78 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ndufaf2Q59J78 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ndufaf2Q59J78 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ndufaf2Q59J78 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ndufaf2Q59J78 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ndufaf2Q59J78 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ndufaf2Q59J78 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ndufaf2Q59J78 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ndufaf2Q59J78 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ndufaf2Q59J78 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ndufaf2Q59J78 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ndufaf2Q59J78 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ndufaf2Q59J78 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ndufaf2Q59J78 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ndufaf2Q59J78 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ndufaf2Q59J78 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ndufaf2Q59J78 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ndufaf2Q59J78 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ndufaf2Q59J78 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ndufaf2Q59J78 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ndufaf2Q59J78 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ndufaf2Q59J78 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ndufaf2Q59J78 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ndufaf2Q59J78 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ndufaf2Q59J78 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ndufaf2Q59J78 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ndufaf2Q59J78 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ndufaf2Q59J78 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ndufaf2Q59J78 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ndufaf2Q59J78 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ndufaf2Q59J78 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ndufaf2Q59J78 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ndufaf2Q59J78 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ndufaf2Q59J78 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ndufaf2Q59J78 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ndufaf2Q59J78 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ndufaf2Q59J78 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ndufaf2Q59J78 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ndufaf2Q59J78 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ndufaf2Q59J78 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ndufaf2Q59J78 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ndufaf2Q59J78 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ndufaf2Q59J78 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ndufaf2Q59J78 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ndufaf2Q59J78 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ndufaf2Q59J78 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ndufaf2Q59J78 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ndufaf2Q59J78 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ndufaf2Q59J78 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ndufaf2Q59J78 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ndufaf2Q59J78 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ndufaf2Q59J78 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ndufaf2Q59J78 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ndufaf2Q59J78 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ndufaf2Q59J78 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ndufaf2Q59J78 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ndufaf2Q59J78 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ndufaf2Q59J78 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ndufaf2Q59J78 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ndufaf2Q59J78 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ndufaf2Q59J78 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ndufaf2Q59J78 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ndufaf2Q59J78 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ndufaf2Q59J78 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ndufaf2Q59J78 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ndufaf2Q59J78 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ndufaf2Q59J78 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ndufaf2Q59J78 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ndufaf2Q59J78 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ndufaf2Q59J78 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ndufaf2Q59J78 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ndufaf2Q59J78 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ndufaf2Q59J78 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms