Protein–RNA interactions for Protein: Q56A10

Znf608, Zinc finger protein 608, mousemouse

Predictions only

Length 1,511 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf608Q56A10 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Znf608Q56A10 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Znf608Q56A10 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Znf608Q56A10 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Znf608Q56A10 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Znf608Q56A10 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Znf608Q56A10 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Znf608Q56A10 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Znf608Q56A10 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Znf608Q56A10 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Znf608Q56A10 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Znf608Q56A10 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Znf608Q56A10 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Znf608Q56A10 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Znf608Q56A10 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Znf608Q56A10 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Znf608Q56A10 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Znf608Q56A10 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Znf608Q56A10 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Znf608Q56A10 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Znf608Q56A10 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Znf608Q56A10 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Znf608Q56A10 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Znf608Q56A10 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Znf608Q56A10 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Znf608Q56A10 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Znf608Q56A10 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Znf608Q56A10 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Znf608Q56A10 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Znf608Q56A10 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Znf608Q56A10 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Znf608Q56A10 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Znf608Q56A10 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Znf608Q56A10 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Znf608Q56A10 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Znf608Q56A10 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Znf608Q56A10 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Znf608Q56A10 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Znf608Q56A10 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Znf608Q56A10 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Znf608Q56A10 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Znf608Q56A10 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Znf608Q56A10 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Znf608Q56A10 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Znf608Q56A10 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Znf608Q56A10 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Znf608Q56A10 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Znf608Q56A10 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Znf608Q56A10 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Znf608Q56A10 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Znf608Q56A10 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Znf608Q56A10 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Znf608Q56A10 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Znf608Q56A10 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Znf608Q56A10 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Znf608Q56A10 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Znf608Q56A10 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Znf608Q56A10 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Znf608Q56A10 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Znf608Q56A10 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Znf608Q56A10 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Znf608Q56A10 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Znf608Q56A10 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Znf608Q56A10 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Znf608Q56A10 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Znf608Q56A10 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Znf608Q56A10 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Znf608Q56A10 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Znf608Q56A10 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Znf608Q56A10 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Znf608Q56A10 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Znf608Q56A10 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Znf608Q56A10 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Znf608Q56A10 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Znf608Q56A10 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Znf608Q56A10 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Znf608Q56A10 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Znf608Q56A10 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Znf608Q56A10 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Znf608Q56A10 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Znf608Q56A10 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Znf608Q56A10 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Znf608Q56A10 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Znf608Q56A10 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Znf608Q56A10 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Znf608Q56A10 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Znf608Q56A10 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Znf608Q56A10 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Znf608Q56A10 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Znf608Q56A10 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Znf608Q56A10 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Znf608Q56A10 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Znf608Q56A10 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Znf608Q56A10 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Znf608Q56A10 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Znf608Q56A10 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Znf608Q56A10 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Znf608Q56A10 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Znf608Q56A10 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Znf608Q56A10 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms