Protein–RNA interactions for Protein: Q505G4

Rtl6, Retrotransposon Gag-like protein 6, mousemouse

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rtl6Q505G4 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Rtl6Q505G4 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rtl6Q505G4 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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Rtl6Q505G4 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Rtl6Q505G4 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rtl6Q505G4 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Rtl6Q505G4 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rtl6Q505G4 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Rtl6Q505G4 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Rtl6Q505G4 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rtl6Q505G4 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rtl6Q505G4 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rtl6Q505G4 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rtl6Q505G4 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rtl6Q505G4 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rtl6Q505G4 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rtl6Q505G4 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rtl6Q505G4 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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