Protein–RNA interactions for Protein: Q4VC17

Adamts18, A disintegrin and metalloproteinase with thrombospondin motifs 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Adamts18Q4VC17 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Adamts18Q4VC17 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Adamts18Q4VC17 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Adamts18Q4VC17 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
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Adamts18Q4VC17 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Adamts18Q4VC17 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Adamts18Q4VC17 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
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Adamts18Q4VC17 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Adamts18Q4VC17 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Adamts18Q4VC17 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Adamts18Q4VC17 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Adamts18Q4VC17 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Adamts18Q4VC17 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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Adamts18Q4VC17 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Adamts18Q4VC17 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Adamts18Q4VC17 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Adamts18Q4VC17 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Adamts18Q4VC17 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Adamts18Q4VC17 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
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Adamts18Q4VC17 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
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Adamts18Q4VC17 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Adamts18Q4VC17 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Adamts18Q4VC17 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Adamts18Q4VC17 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Adamts18Q4VC17 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Adamts18Q4VC17 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Adamts18Q4VC17 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
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Adamts18Q4VC17 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
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Adamts18Q4VC17 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
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Adamts18Q4VC17 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Adamts18Q4VC17 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
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Adamts18Q4VC17 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Adamts18Q4VC17 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Adamts18Q4VC17 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Adamts18Q4VC17 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Adamts18Q4VC17 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Adamts18Q4VC17 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Adamts18Q4VC17 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Adamts18Q4VC17 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Adamts18Q4VC17 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Adamts18Q4VC17 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Adamts18Q4VC17 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Adamts18Q4VC17 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Adamts18Q4VC17 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Adamts18Q4VC17 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Adamts18Q4VC17 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Adamts18Q4VC17 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Adamts18Q4VC17 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Adamts18Q4VC17 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Adamts18Q4VC17 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Adamts18Q4VC17 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Adamts18Q4VC17 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Adamts18Q4VC17 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Adamts18Q4VC17 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Adamts18Q4VC17 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Adamts18Q4VC17 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Adamts18Q4VC17 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms