Protein–RNA interactions for Protein: Q4VA36

Ccdc84, Coiled-coil domain-containing protein 84, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc84Q4VA36 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc84Q4VA36 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc84Q4VA36 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc84Q4VA36 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc84Q4VA36 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc84Q4VA36 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc84Q4VA36 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc84Q4VA36 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc84Q4VA36 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc84Q4VA36 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc84Q4VA36 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc84Q4VA36 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc84Q4VA36 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc84Q4VA36 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc84Q4VA36 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc84Q4VA36 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc84Q4VA36 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc84Q4VA36 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc84Q4VA36 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc84Q4VA36 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc84Q4VA36 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc84Q4VA36 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc84Q4VA36 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc84Q4VA36 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc84Q4VA36 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc84Q4VA36 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc84Q4VA36 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc84Q4VA36 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc84Q4VA36 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc84Q4VA36 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc84Q4VA36 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc84Q4VA36 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc84Q4VA36 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc84Q4VA36 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc84Q4VA36 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc84Q4VA36 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc84Q4VA36 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc84Q4VA36 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc84Q4VA36 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc84Q4VA36 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc84Q4VA36 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc84Q4VA36 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc84Q4VA36 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc84Q4VA36 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc84Q4VA36 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc84Q4VA36 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc84Q4VA36 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc84Q4VA36 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc84Q4VA36 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc84Q4VA36 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc84Q4VA36 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc84Q4VA36 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc84Q4VA36 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc84Q4VA36 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc84Q4VA36 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc84Q4VA36 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ccdc84Q4VA36 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ccdc84Q4VA36 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ccdc84Q4VA36 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ccdc84Q4VA36 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc84Q4VA36 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc84Q4VA36 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc84Q4VA36 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc84Q4VA36 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc84Q4VA36 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc84Q4VA36 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc84Q4VA36 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc84Q4VA36 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc84Q4VA36 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc84Q4VA36 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc84Q4VA36 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc84Q4VA36 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc84Q4VA36 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc84Q4VA36 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc84Q4VA36 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc84Q4VA36 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc84Q4VA36 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc84Q4VA36 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc84Q4VA36 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc84Q4VA36 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc84Q4VA36 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc84Q4VA36 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc84Q4VA36 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc84Q4VA36 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc84Q4VA36 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc84Q4VA36 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc84Q4VA36 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc84Q4VA36 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc84Q4VA36 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc84Q4VA36 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc84Q4VA36 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc84Q4VA36 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc84Q4VA36 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc84Q4VA36 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc84Q4VA36 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc84Q4VA36 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc84Q4VA36 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc84Q4VA36 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc84Q4VA36 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc84Q4VA36 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms