Protein–RNA interactions for Protein: Q4U2R1

Herc2, E3 ubiquitin-protein ligase HERC2, mousemouse

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Length 4,836 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc2Q4U2R1 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Herc2Q4U2R1 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Herc2Q4U2R1 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Herc2Q4U2R1 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Herc2Q4U2R1 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Herc2Q4U2R1 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Herc2Q4U2R1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Herc2Q4U2R1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Herc2Q4U2R1 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Herc2Q4U2R1 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Herc2Q4U2R1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Herc2Q4U2R1 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Herc2Q4U2R1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Herc2Q4U2R1 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Herc2Q4U2R1 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Herc2Q4U2R1 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Herc2Q4U2R1 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Herc2Q4U2R1 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Herc2Q4U2R1 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Herc2Q4U2R1 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Herc2Q4U2R1 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Herc2Q4U2R1 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Herc2Q4U2R1 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Herc2Q4U2R1 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Herc2Q4U2R1 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Herc2Q4U2R1 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Herc2Q4U2R1 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Herc2Q4U2R1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Herc2Q4U2R1 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Herc2Q4U2R1 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Herc2Q4U2R1 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Herc2Q4U2R1 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Herc2Q4U2R1 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Herc2Q4U2R1 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Herc2Q4U2R1 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Herc2Q4U2R1 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Herc2Q4U2R1 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Herc2Q4U2R1 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Herc2Q4U2R1 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Herc2Q4U2R1 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Herc2Q4U2R1 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Herc2Q4U2R1 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Herc2Q4U2R1 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Herc2Q4U2R1 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Herc2Q4U2R1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Herc2Q4U2R1 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Herc2Q4U2R1 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Herc2Q4U2R1 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Herc2Q4U2R1 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Herc2Q4U2R1 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Herc2Q4U2R1 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Herc2Q4U2R1 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Herc2Q4U2R1 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Herc2Q4U2R1 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Herc2Q4U2R1 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Herc2Q4U2R1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Herc2Q4U2R1 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Herc2Q4U2R1 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Herc2Q4U2R1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Herc2Q4U2R1 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Herc2Q4U2R1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Herc2Q4U2R1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Herc2Q4U2R1 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Herc2Q4U2R1 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Herc2Q4U2R1 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Herc2Q4U2R1 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Herc2Q4U2R1 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Herc2Q4U2R1 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Herc2Q4U2R1 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Herc2Q4U2R1 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Herc2Q4U2R1 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Herc2Q4U2R1 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Herc2Q4U2R1 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Herc2Q4U2R1 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Herc2Q4U2R1 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Herc2Q4U2R1 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Herc2Q4U2R1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Herc2Q4U2R1 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Herc2Q4U2R1 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Herc2Q4U2R1 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Herc2Q4U2R1 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Herc2Q4U2R1 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Herc2Q4U2R1 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Herc2Q4U2R1 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Herc2Q4U2R1 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Herc2Q4U2R1 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Herc2Q4U2R1 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Herc2Q4U2R1 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Herc2Q4U2R1 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Herc2Q4U2R1 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Herc2Q4U2R1 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Herc2Q4U2R1 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Herc2Q4U2R1 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Herc2Q4U2R1 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Herc2Q4U2R1 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Herc2Q4U2R1 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Herc2Q4U2R1 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Herc2Q4U2R1 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Herc2Q4U2R1 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Herc2Q4U2R1 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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