Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trappc3lQ4KL14 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trappc3lQ4KL14 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trappc3lQ4KL14 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trappc3lQ4KL14 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trappc3lQ4KL14 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trappc3lQ4KL14 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trappc3lQ4KL14 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trappc3lQ4KL14 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trappc3lQ4KL14 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trappc3lQ4KL14 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trappc3lQ4KL14 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trappc3lQ4KL14 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Trappc3lQ4KL14 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trappc3lQ4KL14 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trappc3lQ4KL14 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trappc3lQ4KL14 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trappc3lQ4KL14 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trappc3lQ4KL14 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trappc3lQ4KL14 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trappc3lQ4KL14 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trappc3lQ4KL14 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trappc3lQ4KL14 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trappc3lQ4KL14 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trappc3lQ4KL14 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Trappc3lQ4KL14 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trappc3lQ4KL14 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trappc3lQ4KL14 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trappc3lQ4KL14 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trappc3lQ4KL14 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trappc3lQ4KL14 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trappc3lQ4KL14 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trappc3lQ4KL14 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trappc3lQ4KL14 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trappc3lQ4KL14 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trappc3lQ4KL14 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trappc3lQ4KL14 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trappc3lQ4KL14 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trappc3lQ4KL14 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trappc3lQ4KL14 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trappc3lQ4KL14 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trappc3lQ4KL14 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trappc3lQ4KL14 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Trappc3lQ4KL14 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trappc3lQ4KL14 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trappc3lQ4KL14 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trappc3lQ4KL14 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trappc3lQ4KL14 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trappc3lQ4KL14 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trappc3lQ4KL14 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trappc3lQ4KL14 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Trappc3lQ4KL14 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trappc3lQ4KL14 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trappc3lQ4KL14 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc3lQ4KL14 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc3lQ4KL14 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc3lQ4KL14 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc3lQ4KL14 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc3lQ4KL14 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc3lQ4KL14 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc3lQ4KL14 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc3lQ4KL14 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc3lQ4KL14 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc3lQ4KL14 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc3lQ4KL14 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc3lQ4KL14 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc3lQ4KL14 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc3lQ4KL14 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc3lQ4KL14 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc3lQ4KL14 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc3lQ4KL14 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc3lQ4KL14 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc3lQ4KL14 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc3lQ4KL14 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc3lQ4KL14 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc3lQ4KL14 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc3lQ4KL14 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc3lQ4KL14 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc3lQ4KL14 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc3lQ4KL14 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc3lQ4KL14 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc3lQ4KL14 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc3lQ4KL14 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc3lQ4KL14 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc3lQ4KL14 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc3lQ4KL14 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc3lQ4KL14 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc3lQ4KL14 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc3lQ4KL14 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc3lQ4KL14 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc3lQ4KL14 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc3lQ4KL14 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc3lQ4KL14 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc3lQ4KL14 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc3lQ4KL14 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc3lQ4KL14 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc3lQ4KL14 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc3lQ4KL14 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc3lQ4KL14 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc3lQ4KL14 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms