Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZAS0

Slc9a2, Sodium/hydrogen exchanger, mousemouse

Predictions only

Length 814 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a2Q3ZAS0 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Slc9a2Q3ZAS0 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Slc9a2Q3ZAS0 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Slc9a2Q3ZAS0 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Slc9a2Q3ZAS0 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc9a2Q3ZAS0 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc9a2Q3ZAS0 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc9a2Q3ZAS0 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc9a2Q3ZAS0 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc9a2Q3ZAS0 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc9a2Q3ZAS0 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc9a2Q3ZAS0 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc9a2Q3ZAS0 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc9a2Q3ZAS0 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc9a2Q3ZAS0 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc9a2Q3ZAS0 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc9a2Q3ZAS0 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc9a2Q3ZAS0 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc9a2Q3ZAS0 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc9a2Q3ZAS0 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc9a2Q3ZAS0 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc9a2Q3ZAS0 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc9a2Q3ZAS0 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc9a2Q3ZAS0 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc9a2Q3ZAS0 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc9a2Q3ZAS0 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc9a2Q3ZAS0 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc9a2Q3ZAS0 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc9a2Q3ZAS0 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc9a2Q3ZAS0 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc9a2Q3ZAS0 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc9a2Q3ZAS0 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc9a2Q3ZAS0 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc9a2Q3ZAS0 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc9a2Q3ZAS0 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc9a2Q3ZAS0 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc9a2Q3ZAS0 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc9a2Q3ZAS0 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc9a2Q3ZAS0 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc9a2Q3ZAS0 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc9a2Q3ZAS0 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc9a2Q3ZAS0 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc9a2Q3ZAS0 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc9a2Q3ZAS0 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc9a2Q3ZAS0 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slc9a2Q3ZAS0 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slc9a2Q3ZAS0 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slc9a2Q3ZAS0 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slc9a2Q3ZAS0 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slc9a2Q3ZAS0 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slc9a2Q3ZAS0 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slc9a2Q3ZAS0 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slc9a2Q3ZAS0 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slc9a2Q3ZAS0 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Slc9a2Q3ZAS0 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slc9a2Q3ZAS0 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slc9a2Q3ZAS0 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slc9a2Q3ZAS0 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slc9a2Q3ZAS0 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slc9a2Q3ZAS0 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc9a2Q3ZAS0 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc9a2Q3ZAS0 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc9a2Q3ZAS0 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc9a2Q3ZAS0 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc9a2Q3ZAS0 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc9a2Q3ZAS0 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc9a2Q3ZAS0 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc9a2Q3ZAS0 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc9a2Q3ZAS0 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc9a2Q3ZAS0 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc9a2Q3ZAS0 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc9a2Q3ZAS0 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc9a2Q3ZAS0 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc9a2Q3ZAS0 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc9a2Q3ZAS0 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc9a2Q3ZAS0 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc9a2Q3ZAS0 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc9a2Q3ZAS0 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc9a2Q3ZAS0 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc9a2Q3ZAS0 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc9a2Q3ZAS0 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc9a2Q3ZAS0 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slc9a2Q3ZAS0 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slc9a2Q3ZAS0 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slc9a2Q3ZAS0 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slc9a2Q3ZAS0 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slc9a2Q3ZAS0 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slc9a2Q3ZAS0 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slc9a2Q3ZAS0 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slc9a2Q3ZAS0 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slc9a2Q3ZAS0 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slc9a2Q3ZAS0 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slc9a2Q3ZAS0 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slc9a2Q3ZAS0 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slc9a2Q3ZAS0 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slc9a2Q3ZAS0 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slc9a2Q3ZAS0 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slc9a2Q3ZAS0 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slc9a2Q3ZAS0 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slc9a2Q3ZAS0 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms