Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1L6

Mtmr11, Myotubularin-related protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtmr11Q3V1L6 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mtmr11Q3V1L6 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mtmr11Q3V1L6 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mtmr11Q3V1L6 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mtmr11Q3V1L6 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mtmr11Q3V1L6 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mtmr11Q3V1L6 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mtmr11Q3V1L6 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mtmr11Q3V1L6 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mtmr11Q3V1L6 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mtmr11Q3V1L6 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mtmr11Q3V1L6 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mtmr11Q3V1L6 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mtmr11Q3V1L6 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mtmr11Q3V1L6 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mtmr11Q3V1L6 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mtmr11Q3V1L6 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mtmr11Q3V1L6 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mtmr11Q3V1L6 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mtmr11Q3V1L6 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mtmr11Q3V1L6 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mtmr11Q3V1L6 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mtmr11Q3V1L6 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mtmr11Q3V1L6 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mtmr11Q3V1L6 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mtmr11Q3V1L6 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mtmr11Q3V1L6 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mtmr11Q3V1L6 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mtmr11Q3V1L6 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mtmr11Q3V1L6 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mtmr11Q3V1L6 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mtmr11Q3V1L6 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Mtmr11Q3V1L6 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mtmr11Q3V1L6 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mtmr11Q3V1L6 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mtmr11Q3V1L6 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mtmr11Q3V1L6 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mtmr11Q3V1L6 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mtmr11Q3V1L6 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mtmr11Q3V1L6 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mtmr11Q3V1L6 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mtmr11Q3V1L6 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mtmr11Q3V1L6 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mtmr11Q3V1L6 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mtmr11Q3V1L6 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mtmr11Q3V1L6 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mtmr11Q3V1L6 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Mtmr11Q3V1L6 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Mtmr11Q3V1L6 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mtmr11Q3V1L6 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mtmr11Q3V1L6 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mtmr11Q3V1L6 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mtmr11Q3V1L6 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mtmr11Q3V1L6 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mtmr11Q3V1L6 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mtmr11Q3V1L6 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mtmr11Q3V1L6 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mtmr11Q3V1L6 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mtmr11Q3V1L6 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mtmr11Q3V1L6 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mtmr11Q3V1L6 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mtmr11Q3V1L6 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Mtmr11Q3V1L6 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mtmr11Q3V1L6 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mtmr11Q3V1L6 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mtmr11Q3V1L6 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mtmr11Q3V1L6 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mtmr11Q3V1L6 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mtmr11Q3V1L6 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mtmr11Q3V1L6 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Mtmr11Q3V1L6 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mtmr11Q3V1L6 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mtmr11Q3V1L6 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mtmr11Q3V1L6 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mtmr11Q3V1L6 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mtmr11Q3V1L6 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mtmr11Q3V1L6 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Mtmr11Q3V1L6 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mtmr11Q3V1L6 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mtmr11Q3V1L6 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mtmr11Q3V1L6 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mtmr11Q3V1L6 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mtmr11Q3V1L6 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mtmr11Q3V1L6 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mtmr11Q3V1L6 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Mtmr11Q3V1L6 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mtmr11Q3V1L6 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mtmr11Q3V1L6 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mtmr11Q3V1L6 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mtmr11Q3V1L6 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mtmr11Q3V1L6 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mtmr11Q3V1L6 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mtmr11Q3V1L6 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mtmr11Q3V1L6 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mtmr11Q3V1L6 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mtmr11Q3V1L6 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Mtmr11Q3V1L6 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mtmr11Q3V1L6 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mtmr11Q3V1L6 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mtmr11Q3V1L6 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms