Protein–RNA interactions for Protein: Q3V125

Ccdc110, Coiled-coil domain-containing protein 110, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc110Q3V125 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc110Q3V125 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc110Q3V125 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc110Q3V125 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc110Q3V125 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc110Q3V125 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc110Q3V125 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc110Q3V125 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc110Q3V125 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc110Q3V125 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc110Q3V125 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc110Q3V125 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc110Q3V125 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc110Q3V125 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc110Q3V125 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc110Q3V125 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc110Q3V125 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc110Q3V125 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc110Q3V125 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc110Q3V125 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc110Q3V125 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc110Q3V125 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc110Q3V125 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc110Q3V125 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc110Q3V125 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc110Q3V125 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc110Q3V125 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc110Q3V125 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc110Q3V125 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc110Q3V125 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc110Q3V125 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc110Q3V125 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc110Q3V125 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc110Q3V125 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc110Q3V125 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc110Q3V125 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc110Q3V125 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc110Q3V125 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc110Q3V125 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc110Q3V125 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc110Q3V125 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc110Q3V125 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc110Q3V125 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc110Q3V125 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc110Q3V125 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc110Q3V125 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc110Q3V125 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc110Q3V125 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc110Q3V125 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc110Q3V125 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc110Q3V125 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc110Q3V125 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc110Q3V125 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc110Q3V125 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc110Q3V125 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc110Q3V125 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc110Q3V125 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc110Q3V125 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc110Q3V125 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc110Q3V125 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc110Q3V125 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc110Q3V125 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc110Q3V125 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc110Q3V125 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc110Q3V125 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc110Q3V125 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc110Q3V125 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc110Q3V125 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc110Q3V125 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc110Q3V125 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc110Q3V125 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc110Q3V125 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc110Q3V125 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc110Q3V125 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc110Q3V125 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc110Q3V125 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc110Q3V125 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc110Q3V125 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc110Q3V125 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc110Q3V125 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc110Q3V125 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc110Q3V125 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc110Q3V125 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc110Q3V125 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc110Q3V125 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc110Q3V125 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc110Q3V125 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc110Q3V125 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc110Q3V125 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc110Q3V125 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc110Q3V125 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc110Q3V125 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc110Q3V125 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc110Q3V125 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc110Q3V125 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc110Q3V125 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc110Q3V125 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc110Q3V125 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc110Q3V125 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc110Q3V125 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms