Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0K5

4930567H17Rik, RIKEN cDNA 4930567H17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930567H17RikQ3V0K5 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
4930567H17RikQ3V0K5 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
4930567H17RikQ3V0K5 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
4930567H17RikQ3V0K5 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
4930567H17RikQ3V0K5 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
4930567H17RikQ3V0K5 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
4930567H17RikQ3V0K5 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
4930567H17RikQ3V0K5 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
4930567H17RikQ3V0K5 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
4930567H17RikQ3V0K5 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
4930567H17RikQ3V0K5 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
4930567H17RikQ3V0K5 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
4930567H17RikQ3V0K5 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
4930567H17RikQ3V0K5 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
4930567H17RikQ3V0K5 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
4930567H17RikQ3V0K5 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
4930567H17RikQ3V0K5 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
4930567H17RikQ3V0K5 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
4930567H17RikQ3V0K5 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
4930567H17RikQ3V0K5 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
4930567H17RikQ3V0K5 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
4930567H17RikQ3V0K5 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
4930567H17RikQ3V0K5 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
4930567H17RikQ3V0K5 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
4930567H17RikQ3V0K5 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
4930567H17RikQ3V0K5 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
4930567H17RikQ3V0K5 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
4930567H17RikQ3V0K5 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
4930567H17RikQ3V0K5 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
4930567H17RikQ3V0K5 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
4930567H17RikQ3V0K5 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
4930567H17RikQ3V0K5 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
4930567H17RikQ3V0K5 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
4930567H17RikQ3V0K5 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
4930567H17RikQ3V0K5 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
4930567H17RikQ3V0K5 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
4930567H17RikQ3V0K5 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
4930567H17RikQ3V0K5 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
4930567H17RikQ3V0K5 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
4930567H17RikQ3V0K5 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
4930567H17RikQ3V0K5 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
4930567H17RikQ3V0K5 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
4930567H17RikQ3V0K5 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
4930567H17RikQ3V0K5 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
4930567H17RikQ3V0K5 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
4930567H17RikQ3V0K5 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
4930567H17RikQ3V0K5 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
4930567H17RikQ3V0K5 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
4930567H17RikQ3V0K5 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
4930567H17RikQ3V0K5 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
4930567H17RikQ3V0K5 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
4930567H17RikQ3V0K5 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
4930567H17RikQ3V0K5 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
4930567H17RikQ3V0K5 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
4930567H17RikQ3V0K5 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
4930567H17RikQ3V0K5 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
4930567H17RikQ3V0K5 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
4930567H17RikQ3V0K5 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
4930567H17RikQ3V0K5 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
4930567H17RikQ3V0K5 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
4930567H17RikQ3V0K5 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
4930567H17RikQ3V0K5 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
4930567H17RikQ3V0K5 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
4930567H17RikQ3V0K5 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
4930567H17RikQ3V0K5 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
4930567H17RikQ3V0K5 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
4930567H17RikQ3V0K5 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
4930567H17RikQ3V0K5 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
4930567H17RikQ3V0K5 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
4930567H17RikQ3V0K5 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
4930567H17RikQ3V0K5 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
4930567H17RikQ3V0K5 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
4930567H17RikQ3V0K5 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
4930567H17RikQ3V0K5 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
4930567H17RikQ3V0K5 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
4930567H17RikQ3V0K5 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
4930567H17RikQ3V0K5 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
4930567H17RikQ3V0K5 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
4930567H17RikQ3V0K5 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
4930567H17RikQ3V0K5 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
4930567H17RikQ3V0K5 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
4930567H17RikQ3V0K5 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
4930567H17RikQ3V0K5 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
4930567H17RikQ3V0K5 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
4930567H17RikQ3V0K5 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
4930567H17RikQ3V0K5 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
4930567H17RikQ3V0K5 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
4930567H17RikQ3V0K5 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
4930567H17RikQ3V0K5 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
4930567H17RikQ3V0K5 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
4930567H17RikQ3V0K5 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
4930567H17RikQ3V0K5 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
4930567H17RikQ3V0K5 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
4930567H17RikQ3V0K5 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
4930567H17RikQ3V0K5 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
4930567H17RikQ3V0K5 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
4930567H17RikQ3V0K5 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
4930567H17RikQ3V0K5 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
4930567H17RikQ3V0K5 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
4930567H17RikQ3V0K5 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms