Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0G7

Garnl3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Garnl3Q3V0G7 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Garnl3Q3V0G7 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Garnl3Q3V0G7 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Garnl3Q3V0G7 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Garnl3Q3V0G7 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Garnl3Q3V0G7 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Garnl3Q3V0G7 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Garnl3Q3V0G7 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Garnl3Q3V0G7 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Garnl3Q3V0G7 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Garnl3Q3V0G7 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Garnl3Q3V0G7 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Garnl3Q3V0G7 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Garnl3Q3V0G7 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Garnl3Q3V0G7 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Garnl3Q3V0G7 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Garnl3Q3V0G7 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Garnl3Q3V0G7 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Garnl3Q3V0G7 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Garnl3Q3V0G7 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Garnl3Q3V0G7 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Garnl3Q3V0G7 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Garnl3Q3V0G7 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Garnl3Q3V0G7 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Garnl3Q3V0G7 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Garnl3Q3V0G7 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Garnl3Q3V0G7 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Garnl3Q3V0G7 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Garnl3Q3V0G7 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Garnl3Q3V0G7 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Garnl3Q3V0G7 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Garnl3Q3V0G7 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Garnl3Q3V0G7 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Garnl3Q3V0G7 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Garnl3Q3V0G7 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Garnl3Q3V0G7 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Garnl3Q3V0G7 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Garnl3Q3V0G7 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Garnl3Q3V0G7 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Garnl3Q3V0G7 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Garnl3Q3V0G7 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Garnl3Q3V0G7 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Garnl3Q3V0G7 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Garnl3Q3V0G7 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Garnl3Q3V0G7 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Garnl3Q3V0G7 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Garnl3Q3V0G7 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Garnl3Q3V0G7 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Garnl3Q3V0G7 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Garnl3Q3V0G7 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Garnl3Q3V0G7 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Garnl3Q3V0G7 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Garnl3Q3V0G7 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Garnl3Q3V0G7 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Garnl3Q3V0G7 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Garnl3Q3V0G7 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Garnl3Q3V0G7 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Garnl3Q3V0G7 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Garnl3Q3V0G7 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Garnl3Q3V0G7 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Garnl3Q3V0G7 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Garnl3Q3V0G7 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Garnl3Q3V0G7 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Garnl3Q3V0G7 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Garnl3Q3V0G7 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Garnl3Q3V0G7 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Garnl3Q3V0G7 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Garnl3Q3V0G7 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Garnl3Q3V0G7 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Garnl3Q3V0G7 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Garnl3Q3V0G7 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Garnl3Q3V0G7 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Garnl3Q3V0G7 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Garnl3Q3V0G7 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Garnl3Q3V0G7 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Garnl3Q3V0G7 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Garnl3Q3V0G7 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Garnl3Q3V0G7 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Garnl3Q3V0G7 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Garnl3Q3V0G7 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Garnl3Q3V0G7 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Garnl3Q3V0G7 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Garnl3Q3V0G7 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Garnl3Q3V0G7 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Garnl3Q3V0G7 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Garnl3Q3V0G7 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Garnl3Q3V0G7 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Garnl3Q3V0G7 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Garnl3Q3V0G7 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Garnl3Q3V0G7 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Garnl3Q3V0G7 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Garnl3Q3V0G7 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Garnl3Q3V0G7 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Garnl3Q3V0G7 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Garnl3Q3V0G7 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Garnl3Q3V0G7 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Garnl3Q3V0G7 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Garnl3Q3V0G7 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Garnl3Q3V0G7 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Garnl3Q3V0G7 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms