Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

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Length 1,052 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp48Q3V0C5 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp48Q3V0C5 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp48Q3V0C5 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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Usp48Q3V0C5 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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Usp48Q3V0C5 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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Usp48Q3V0C5 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp48Q3V0C5 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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Usp48Q3V0C5 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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Usp48Q3V0C5 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Usp48Q3V0C5 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Usp48Q3V0C5 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Usp48Q3V0C5 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Usp48Q3V0C5 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Usp48Q3V0C5 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Usp48Q3V0C5 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Usp48Q3V0C5 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Usp48Q3V0C5 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Usp48Q3V0C5 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Usp48Q3V0C5 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Usp48Q3V0C5 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Usp48Q3V0C5 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Usp48Q3V0C5 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
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