Protein–RNA interactions for Protein: Q3V036

Ccdc27, Coiled-coil domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc27Q3V036 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc27Q3V036 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc27Q3V036 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc27Q3V036 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc27Q3V036 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc27Q3V036 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc27Q3V036 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc27Q3V036 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc27Q3V036 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc27Q3V036 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc27Q3V036 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc27Q3V036 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc27Q3V036 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc27Q3V036 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc27Q3V036 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc27Q3V036 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc27Q3V036 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc27Q3V036 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc27Q3V036 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc27Q3V036 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc27Q3V036 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc27Q3V036 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc27Q3V036 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc27Q3V036 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc27Q3V036 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc27Q3V036 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc27Q3V036 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc27Q3V036 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc27Q3V036 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc27Q3V036 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc27Q3V036 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc27Q3V036 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc27Q3V036 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc27Q3V036 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc27Q3V036 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc27Q3V036 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc27Q3V036 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc27Q3V036 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc27Q3V036 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc27Q3V036 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc27Q3V036 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc27Q3V036 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc27Q3V036 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc27Q3V036 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc27Q3V036 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc27Q3V036 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc27Q3V036 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc27Q3V036 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc27Q3V036 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc27Q3V036 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc27Q3V036 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ccdc27Q3V036 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc27Q3V036 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc27Q3V036 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc27Q3V036 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc27Q3V036 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc27Q3V036 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc27Q3V036 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc27Q3V036 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc27Q3V036 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc27Q3V036 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc27Q3V036 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc27Q3V036 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc27Q3V036 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc27Q3V036 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc27Q3V036 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc27Q3V036 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc27Q3V036 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc27Q3V036 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc27Q3V036 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc27Q3V036 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc27Q3V036 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc27Q3V036 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc27Q3V036 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc27Q3V036 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc27Q3V036 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc27Q3V036 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc27Q3V036 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc27Q3V036 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc27Q3V036 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc27Q3V036 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc27Q3V036 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc27Q3V036 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc27Q3V036 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc27Q3V036 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc27Q3V036 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc27Q3V036 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc27Q3V036 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc27Q3V036 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc27Q3V036 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc27Q3V036 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc27Q3V036 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc27Q3V036 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc27Q3V036 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc27Q3V036 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc27Q3V036 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc27Q3V036 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc27Q3V036 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc27Q3V036 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc27Q3V036 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms