Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYV8

Dnaaf3, Dynein assembly factor 3, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaaf3Q3UYV8 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dnaaf3Q3UYV8 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dnaaf3Q3UYV8 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dnaaf3Q3UYV8 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dnaaf3Q3UYV8 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dnaaf3Q3UYV8 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dnaaf3Q3UYV8 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dnaaf3Q3UYV8 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dnaaf3Q3UYV8 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dnaaf3Q3UYV8 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dnaaf3Q3UYV8 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dnaaf3Q3UYV8 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dnaaf3Q3UYV8 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dnaaf3Q3UYV8 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dnaaf3Q3UYV8 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Dnaaf3Q3UYV8 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dnaaf3Q3UYV8 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Dnaaf3Q3UYV8 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dnaaf3Q3UYV8 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dnaaf3Q3UYV8 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Dnaaf3Q3UYV8 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Dnaaf3Q3UYV8 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dnaaf3Q3UYV8 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dnaaf3Q3UYV8 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dnaaf3Q3UYV8 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dnaaf3Q3UYV8 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dnaaf3Q3UYV8 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dnaaf3Q3UYV8 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dnaaf3Q3UYV8 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dnaaf3Q3UYV8 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dnaaf3Q3UYV8 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dnaaf3Q3UYV8 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
Dnaaf3Q3UYV8 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Dnaaf3Q3UYV8 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dnaaf3Q3UYV8 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dnaaf3Q3UYV8 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dnaaf3Q3UYV8 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dnaaf3Q3UYV8 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dnaaf3Q3UYV8 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dnaaf3Q3UYV8 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dnaaf3Q3UYV8 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dnaaf3Q3UYV8 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dnaaf3Q3UYV8 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dnaaf3Q3UYV8 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dnaaf3Q3UYV8 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dnaaf3Q3UYV8 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dnaaf3Q3UYV8 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dnaaf3Q3UYV8 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dnaaf3Q3UYV8 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dnaaf3Q3UYV8 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Dnaaf3Q3UYV8 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dnaaf3Q3UYV8 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Dnaaf3Q3UYV8 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dnaaf3Q3UYV8 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dnaaf3Q3UYV8 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dnaaf3Q3UYV8 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Dnaaf3Q3UYV8 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dnaaf3Q3UYV8 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dnaaf3Q3UYV8 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dnaaf3Q3UYV8 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dnaaf3Q3UYV8 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dnaaf3Q3UYV8 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dnaaf3Q3UYV8 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dnaaf3Q3UYV8 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dnaaf3Q3UYV8 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dnaaf3Q3UYV8 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dnaaf3Q3UYV8 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dnaaf3Q3UYV8 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dnaaf3Q3UYV8 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dnaaf3Q3UYV8 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dnaaf3Q3UYV8 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dnaaf3Q3UYV8 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dnaaf3Q3UYV8 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dnaaf3Q3UYV8 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dnaaf3Q3UYV8 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dnaaf3Q3UYV8 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dnaaf3Q3UYV8 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dnaaf3Q3UYV8 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dnaaf3Q3UYV8 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dnaaf3Q3UYV8 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dnaaf3Q3UYV8 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dnaaf3Q3UYV8 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dnaaf3Q3UYV8 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnaaf3Q3UYV8 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnaaf3Q3UYV8 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnaaf3Q3UYV8 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnaaf3Q3UYV8 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnaaf3Q3UYV8 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnaaf3Q3UYV8 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnaaf3Q3UYV8 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnaaf3Q3UYV8 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnaaf3Q3UYV8 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnaaf3Q3UYV8 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnaaf3Q3UYV8 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnaaf3Q3UYV8 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnaaf3Q3UYV8 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnaaf3Q3UYV8 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnaaf3Q3UYV8 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnaaf3Q3UYV8 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnaaf3Q3UYV8 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms