Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWQ3

Ube2fb, NEDD8-conjugating enzyme UBE2F-B, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2fbQ3UWQ3 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2fbQ3UWQ3 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2fbQ3UWQ3 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2fbQ3UWQ3 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2fbQ3UWQ3 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2fbQ3UWQ3 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2fbQ3UWQ3 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2fbQ3UWQ3 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2fbQ3UWQ3 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2fbQ3UWQ3 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2fbQ3UWQ3 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2fbQ3UWQ3 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2fbQ3UWQ3 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2fbQ3UWQ3 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2fbQ3UWQ3 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2fbQ3UWQ3 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2fbQ3UWQ3 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2fbQ3UWQ3 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2fbQ3UWQ3 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2fbQ3UWQ3 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2fbQ3UWQ3 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2fbQ3UWQ3 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2fbQ3UWQ3 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2fbQ3UWQ3 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2fbQ3UWQ3 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2fbQ3UWQ3 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2fbQ3UWQ3 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2fbQ3UWQ3 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2fbQ3UWQ3 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2fbQ3UWQ3 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2fbQ3UWQ3 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2fbQ3UWQ3 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2fbQ3UWQ3 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2fbQ3UWQ3 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2fbQ3UWQ3 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2fbQ3UWQ3 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2fbQ3UWQ3 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2fbQ3UWQ3 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2fbQ3UWQ3 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2fbQ3UWQ3 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2fbQ3UWQ3 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2fbQ3UWQ3 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2fbQ3UWQ3 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2fbQ3UWQ3 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2fbQ3UWQ3 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2fbQ3UWQ3 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2fbQ3UWQ3 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2fbQ3UWQ3 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2fbQ3UWQ3 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2fbQ3UWQ3 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2fbQ3UWQ3 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2fbQ3UWQ3 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2fbQ3UWQ3 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2fbQ3UWQ3 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2fbQ3UWQ3 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2fbQ3UWQ3 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2fbQ3UWQ3 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2fbQ3UWQ3 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2fbQ3UWQ3 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2fbQ3UWQ3 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2fbQ3UWQ3 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2fbQ3UWQ3 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2fbQ3UWQ3 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2fbQ3UWQ3 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2fbQ3UWQ3 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2fbQ3UWQ3 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2fbQ3UWQ3 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2fbQ3UWQ3 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ube2fbQ3UWQ3 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ube2fbQ3UWQ3 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ube2fbQ3UWQ3 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2fbQ3UWQ3 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2fbQ3UWQ3 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2fbQ3UWQ3 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2fbQ3UWQ3 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2fbQ3UWQ3 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2fbQ3UWQ3 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2fbQ3UWQ3 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2fbQ3UWQ3 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2fbQ3UWQ3 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2fbQ3UWQ3 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2fbQ3UWQ3 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2fbQ3UWQ3 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2fbQ3UWQ3 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2fbQ3UWQ3 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2fbQ3UWQ3 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2fbQ3UWQ3 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2fbQ3UWQ3 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2fbQ3UWQ3 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2fbQ3UWQ3 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2fbQ3UWQ3 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2fbQ3UWQ3 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2fbQ3UWQ3 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2fbQ3UWQ3 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2fbQ3UWQ3 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2fbQ3UWQ3 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2fbQ3UWQ3 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2fbQ3UWQ3 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2fbQ3UWQ3 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2fbQ3UWQ3 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms