Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW98

Clca4b, Chloride channel accessory 4B, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca4bQ3UW98 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clca4bQ3UW98 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clca4bQ3UW98 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clca4bQ3UW98 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clca4bQ3UW98 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clca4bQ3UW98 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clca4bQ3UW98 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Clca4bQ3UW98 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clca4bQ3UW98 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clca4bQ3UW98 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clca4bQ3UW98 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clca4bQ3UW98 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clca4bQ3UW98 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clca4bQ3UW98 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clca4bQ3UW98 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clca4bQ3UW98 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clca4bQ3UW98 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clca4bQ3UW98 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clca4bQ3UW98 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clca4bQ3UW98 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clca4bQ3UW98 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clca4bQ3UW98 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clca4bQ3UW98 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clca4bQ3UW98 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clca4bQ3UW98 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clca4bQ3UW98 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clca4bQ3UW98 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clca4bQ3UW98 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clca4bQ3UW98 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clca4bQ3UW98 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clca4bQ3UW98 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clca4bQ3UW98 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clca4bQ3UW98 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clca4bQ3UW98 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clca4bQ3UW98 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clca4bQ3UW98 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clca4bQ3UW98 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clca4bQ3UW98 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clca4bQ3UW98 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clca4bQ3UW98 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clca4bQ3UW98 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clca4bQ3UW98 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clca4bQ3UW98 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clca4bQ3UW98 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Clca4bQ3UW98 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clca4bQ3UW98 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clca4bQ3UW98 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clca4bQ3UW98 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clca4bQ3UW98 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clca4bQ3UW98 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clca4bQ3UW98 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clca4bQ3UW98 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clca4bQ3UW98 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clca4bQ3UW98 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clca4bQ3UW98 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clca4bQ3UW98 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clca4bQ3UW98 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clca4bQ3UW98 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clca4bQ3UW98 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clca4bQ3UW98 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clca4bQ3UW98 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clca4bQ3UW98 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clca4bQ3UW98 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clca4bQ3UW98 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clca4bQ3UW98 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clca4bQ3UW98 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clca4bQ3UW98 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clca4bQ3UW98 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clca4bQ3UW98 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clca4bQ3UW98 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Clca4bQ3UW98 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clca4bQ3UW98 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clca4bQ3UW98 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clca4bQ3UW98 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clca4bQ3UW98 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clca4bQ3UW98 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clca4bQ3UW98 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clca4bQ3UW98 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Clca4bQ3UW98 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clca4bQ3UW98 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clca4bQ3UW98 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clca4bQ3UW98 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clca4bQ3UW98 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clca4bQ3UW98 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clca4bQ3UW98 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clca4bQ3UW98 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Clca4bQ3UW98 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clca4bQ3UW98 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clca4bQ3UW98 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clca4bQ3UW98 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clca4bQ3UW98 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clca4bQ3UW98 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clca4bQ3UW98 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clca4bQ3UW98 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clca4bQ3UW98 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clca4bQ3UW98 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clca4bQ3UW98 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clca4bQ3UW98 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clca4bQ3UW98 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clca4bQ3UW98 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms