Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW50

Gm27235, Predicted gene 27235, mousemouse

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm27235Q3UW50 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm27235Q3UW50 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm27235Q3UW50 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm27235Q3UW50 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm27235Q3UW50 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm27235Q3UW50 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm27235Q3UW50 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm27235Q3UW50 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm27235Q3UW50 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm27235Q3UW50 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm27235Q3UW50 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm27235Q3UW50 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm27235Q3UW50 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm27235Q3UW50 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm27235Q3UW50 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm27235Q3UW50 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm27235Q3UW50 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm27235Q3UW50 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm27235Q3UW50 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm27235Q3UW50 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm27235Q3UW50 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm27235Q3UW50 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm27235Q3UW50 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm27235Q3UW50 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm27235Q3UW50 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm27235Q3UW50 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm27235Q3UW50 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm27235Q3UW50 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm27235Q3UW50 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm27235Q3UW50 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm27235Q3UW50 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm27235Q3UW50 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm27235Q3UW50 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm27235Q3UW50 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm27235Q3UW50 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm27235Q3UW50 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm27235Q3UW50 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm27235Q3UW50 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm27235Q3UW50 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm27235Q3UW50 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm27235Q3UW50 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm27235Q3UW50 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm27235Q3UW50 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm27235Q3UW50 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm27235Q3UW50 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm27235Q3UW50 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm27235Q3UW50 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm27235Q3UW50 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm27235Q3UW50 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm27235Q3UW50 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm27235Q3UW50 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm27235Q3UW50 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm27235Q3UW50 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm27235Q3UW50 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm27235Q3UW50 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm27235Q3UW50 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm27235Q3UW50 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Gm27235Q3UW50 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm27235Q3UW50 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm27235Q3UW50 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm27235Q3UW50 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm27235Q3UW50 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm27235Q3UW50 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm27235Q3UW50 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm27235Q3UW50 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm27235Q3UW50 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm27235Q3UW50 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm27235Q3UW50 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm27235Q3UW50 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm27235Q3UW50 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm27235Q3UW50 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm27235Q3UW50 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm27235Q3UW50 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm27235Q3UW50 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm27235Q3UW50 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm27235Q3UW50 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm27235Q3UW50 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm27235Q3UW50 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm27235Q3UW50 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm27235Q3UW50 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm27235Q3UW50 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm27235Q3UW50 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm27235Q3UW50 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm27235Q3UW50 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm27235Q3UW50 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm27235Q3UW50 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm27235Q3UW50 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm27235Q3UW50 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm27235Q3UW50 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm27235Q3UW50 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm27235Q3UW50 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm27235Q3UW50 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm27235Q3UW50 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm27235Q3UW50 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm27235Q3UW50 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm27235Q3UW50 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm27235Q3UW50 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm27235Q3UW50 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm27235Q3UW50 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm27235Q3UW50 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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