Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW31

Pate2, Prostate and testis expressed protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate2Q3UW31 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pate2Q3UW31 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pate2Q3UW31 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pate2Q3UW31 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pate2Q3UW31 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pate2Q3UW31 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pate2Q3UW31 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pate2Q3UW31 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pate2Q3UW31 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pate2Q3UW31 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pate2Q3UW31 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pate2Q3UW31 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pate2Q3UW31 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pate2Q3UW31 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pate2Q3UW31 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pate2Q3UW31 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pate2Q3UW31 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pate2Q3UW31 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pate2Q3UW31 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pate2Q3UW31 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pate2Q3UW31 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pate2Q3UW31 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pate2Q3UW31 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pate2Q3UW31 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pate2Q3UW31 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pate2Q3UW31 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pate2Q3UW31 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pate2Q3UW31 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pate2Q3UW31 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pate2Q3UW31 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pate2Q3UW31 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pate2Q3UW31 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pate2Q3UW31 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pate2Q3UW31 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pate2Q3UW31 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pate2Q3UW31 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pate2Q3UW31 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pate2Q3UW31 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pate2Q3UW31 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pate2Q3UW31 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pate2Q3UW31 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pate2Q3UW31 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pate2Q3UW31 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pate2Q3UW31 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pate2Q3UW31 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pate2Q3UW31 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pate2Q3UW31 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pate2Q3UW31 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pate2Q3UW31 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pate2Q3UW31 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pate2Q3UW31 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pate2Q3UW31 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pate2Q3UW31 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pate2Q3UW31 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pate2Q3UW31 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pate2Q3UW31 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pate2Q3UW31 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pate2Q3UW31 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pate2Q3UW31 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pate2Q3UW31 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pate2Q3UW31 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pate2Q3UW31 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pate2Q3UW31 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pate2Q3UW31 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pate2Q3UW31 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pate2Q3UW31 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pate2Q3UW31 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pate2Q3UW31 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pate2Q3UW31 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pate2Q3UW31 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pate2Q3UW31 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pate2Q3UW31 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pate2Q3UW31 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pate2Q3UW31 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pate2Q3UW31 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pate2Q3UW31 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pate2Q3UW31 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pate2Q3UW31 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pate2Q3UW31 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pate2Q3UW31 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pate2Q3UW31 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pate2Q3UW31 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pate2Q3UW31 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pate2Q3UW31 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pate2Q3UW31 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pate2Q3UW31 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pate2Q3UW31 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pate2Q3UW31 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pate2Q3UW31 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pate2Q3UW31 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pate2Q3UW31 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pate2Q3UW31 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pate2Q3UW31 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pate2Q3UW31 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pate2Q3UW31 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pate2Q3UW31 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pate2Q3UW31 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pate2Q3UW31 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pate2Q3UW31 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pate2Q3UW31 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms