Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV66

Slfn4, Schlafen 4, mousemouse

Predictions only

Length 602 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn4Q3UV66 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slfn4Q3UV66 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slfn4Q3UV66 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slfn4Q3UV66 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slfn4Q3UV66 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slfn4Q3UV66 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slfn4Q3UV66 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slfn4Q3UV66 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slfn4Q3UV66 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slfn4Q3UV66 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slfn4Q3UV66 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slfn4Q3UV66 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slfn4Q3UV66 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slfn4Q3UV66 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slfn4Q3UV66 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slfn4Q3UV66 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slfn4Q3UV66 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slfn4Q3UV66 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slfn4Q3UV66 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slfn4Q3UV66 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slfn4Q3UV66 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slfn4Q3UV66 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slfn4Q3UV66 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slfn4Q3UV66 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slfn4Q3UV66 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slfn4Q3UV66 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slfn4Q3UV66 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slfn4Q3UV66 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slfn4Q3UV66 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slfn4Q3UV66 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slfn4Q3UV66 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slfn4Q3UV66 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slfn4Q3UV66 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slfn4Q3UV66 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slfn4Q3UV66 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slfn4Q3UV66 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slfn4Q3UV66 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slfn4Q3UV66 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slfn4Q3UV66 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slfn4Q3UV66 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slfn4Q3UV66 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Slfn4Q3UV66 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slfn4Q3UV66 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slfn4Q3UV66 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slfn4Q3UV66 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slfn4Q3UV66 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Slfn4Q3UV66 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slfn4Q3UV66 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Slfn4Q3UV66 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slfn4Q3UV66 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slfn4Q3UV66 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slfn4Q3UV66 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slfn4Q3UV66 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slfn4Q3UV66 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slfn4Q3UV66 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slfn4Q3UV66 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slfn4Q3UV66 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slfn4Q3UV66 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slfn4Q3UV66 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slfn4Q3UV66 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slfn4Q3UV66 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slfn4Q3UV66 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slfn4Q3UV66 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slfn4Q3UV66 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slfn4Q3UV66 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slfn4Q3UV66 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slfn4Q3UV66 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slfn4Q3UV66 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slfn4Q3UV66 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slfn4Q3UV66 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slfn4Q3UV66 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slfn4Q3UV66 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slfn4Q3UV66 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Slfn4Q3UV66 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slfn4Q3UV66 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slfn4Q3UV66 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slfn4Q3UV66 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slfn4Q3UV66 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slfn4Q3UV66 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slfn4Q3UV66 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slfn4Q3UV66 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Slfn4Q3UV66 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slfn4Q3UV66 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slfn4Q3UV66 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slfn4Q3UV66 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slfn4Q3UV66 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slfn4Q3UV66 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slfn4Q3UV66 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slfn4Q3UV66 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slfn4Q3UV66 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Slfn4Q3UV66 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slfn4Q3UV66 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slfn4Q3UV66 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slfn4Q3UV66 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slfn4Q3UV66 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slfn4Q3UV66 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slfn4Q3UV66 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slfn4Q3UV66 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slfn4Q3UV66 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slfn4Q3UV66 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms