Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUV9

H2-Eb2, Histocompatibility 2, class II antigen E beta2, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb2Q3UUV9 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-Eb2Q3UUV9 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-Eb2Q3UUV9 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-Eb2Q3UUV9 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-Eb2Q3UUV9 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-Eb2Q3UUV9 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-Eb2Q3UUV9 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-Eb2Q3UUV9 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-Eb2Q3UUV9 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-Eb2Q3UUV9 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-Eb2Q3UUV9 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-Eb2Q3UUV9 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-Eb2Q3UUV9 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-Eb2Q3UUV9 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-Eb2Q3UUV9 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-Eb2Q3UUV9 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-Eb2Q3UUV9 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-Eb2Q3UUV9 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
H2-Eb2Q3UUV9 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-Eb2Q3UUV9 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-Eb2Q3UUV9 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-Eb2Q3UUV9 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-Eb2Q3UUV9 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-Eb2Q3UUV9 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-Eb2Q3UUV9 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-Eb2Q3UUV9 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-Eb2Q3UUV9 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-Eb2Q3UUV9 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-Eb2Q3UUV9 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-Eb2Q3UUV9 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-Eb2Q3UUV9 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-Eb2Q3UUV9 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-Eb2Q3UUV9 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-Eb2Q3UUV9 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-Eb2Q3UUV9 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-Eb2Q3UUV9 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-Eb2Q3UUV9 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-Eb2Q3UUV9 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-Eb2Q3UUV9 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-Eb2Q3UUV9 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-Eb2Q3UUV9 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-Eb2Q3UUV9 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-Eb2Q3UUV9 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-Eb2Q3UUV9 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-Eb2Q3UUV9 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-Eb2Q3UUV9 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-Eb2Q3UUV9 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-Eb2Q3UUV9 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-Eb2Q3UUV9 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-Eb2Q3UUV9 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-Eb2Q3UUV9 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-Eb2Q3UUV9 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-Eb2Q3UUV9 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-Eb2Q3UUV9 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-Eb2Q3UUV9 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-Eb2Q3UUV9 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-Eb2Q3UUV9 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-Eb2Q3UUV9 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-Eb2Q3UUV9 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-Eb2Q3UUV9 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-Eb2Q3UUV9 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-Eb2Q3UUV9 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-Eb2Q3UUV9 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-Eb2Q3UUV9 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-Eb2Q3UUV9 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-Eb2Q3UUV9 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-Eb2Q3UUV9 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-Eb2Q3UUV9 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-Eb2Q3UUV9 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-Eb2Q3UUV9 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-Eb2Q3UUV9 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-Eb2Q3UUV9 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-Eb2Q3UUV9 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-Eb2Q3UUV9 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-Eb2Q3UUV9 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-Eb2Q3UUV9 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-Eb2Q3UUV9 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-Eb2Q3UUV9 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-Eb2Q3UUV9 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-Eb2Q3UUV9 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-Eb2Q3UUV9 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-Eb2Q3UUV9 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-Eb2Q3UUV9 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-Eb2Q3UUV9 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-Eb2Q3UUV9 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-Eb2Q3UUV9 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-Eb2Q3UUV9 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-Eb2Q3UUV9 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-Eb2Q3UUV9 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-Eb2Q3UUV9 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-Eb2Q3UUV9 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-Eb2Q3UUV9 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-Eb2Q3UUV9 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-Eb2Q3UUV9 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-Eb2Q3UUV9 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-Eb2Q3UUV9 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-Eb2Q3UUV9 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-Eb2Q3UUV9 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-Eb2Q3UUV9 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-Eb2Q3UUV9 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms