Protein–RNA interactions for Protein: Q3USS0

Gm6899, Predicted gene 6899, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6899Q3USS0 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm6899Q3USS0 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm6899Q3USS0 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm6899Q3USS0 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm6899Q3USS0 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm6899Q3USS0 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm6899Q3USS0 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm6899Q3USS0 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm6899Q3USS0 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm6899Q3USS0 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm6899Q3USS0 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm6899Q3USS0 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm6899Q3USS0 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm6899Q3USS0 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm6899Q3USS0 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm6899Q3USS0 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm6899Q3USS0 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm6899Q3USS0 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm6899Q3USS0 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm6899Q3USS0 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm6899Q3USS0 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm6899Q3USS0 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm6899Q3USS0 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm6899Q3USS0 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm6899Q3USS0 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm6899Q3USS0 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm6899Q3USS0 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm6899Q3USS0 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm6899Q3USS0 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm6899Q3USS0 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm6899Q3USS0 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm6899Q3USS0 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm6899Q3USS0 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm6899Q3USS0 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm6899Q3USS0 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm6899Q3USS0 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm6899Q3USS0 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm6899Q3USS0 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm6899Q3USS0 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm6899Q3USS0 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm6899Q3USS0 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm6899Q3USS0 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm6899Q3USS0 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm6899Q3USS0 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm6899Q3USS0 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm6899Q3USS0 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm6899Q3USS0 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm6899Q3USS0 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm6899Q3USS0 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm6899Q3USS0 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm6899Q3USS0 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm6899Q3USS0 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm6899Q3USS0 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm6899Q3USS0 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm6899Q3USS0 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm6899Q3USS0 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm6899Q3USS0 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm6899Q3USS0 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm6899Q3USS0 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm6899Q3USS0 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm6899Q3USS0 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm6899Q3USS0 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm6899Q3USS0 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm6899Q3USS0 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm6899Q3USS0 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm6899Q3USS0 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm6899Q3USS0 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm6899Q3USS0 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm6899Q3USS0 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm6899Q3USS0 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm6899Q3USS0 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm6899Q3USS0 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm6899Q3USS0 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm6899Q3USS0 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm6899Q3USS0 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm6899Q3USS0 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm6899Q3USS0 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm6899Q3USS0 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm6899Q3USS0 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm6899Q3USS0 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm6899Q3USS0 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm6899Q3USS0 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm6899Q3USS0 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm6899Q3USS0 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm6899Q3USS0 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm6899Q3USS0 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm6899Q3USS0 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm6899Q3USS0 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm6899Q3USS0 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm6899Q3USS0 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm6899Q3USS0 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm6899Q3USS0 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm6899Q3USS0 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm6899Q3USS0 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm6899Q3USS0 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm6899Q3USS0 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm6899Q3USS0 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm6899Q3USS0 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm6899Q3USS0 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm6899Q3USS0 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms