Protein–RNA interactions for Protein: Q3URY0

Rtl4, Retrotransposon Gag-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl4Q3URY0 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rtl4Q3URY0 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rtl4Q3URY0 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rtl4Q3URY0 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rtl4Q3URY0 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rtl4Q3URY0 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rtl4Q3URY0 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rtl4Q3URY0 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Rtl4Q3URY0 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rtl4Q3URY0 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rtl4Q3URY0 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rtl4Q3URY0 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rtl4Q3URY0 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rtl4Q3URY0 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rtl4Q3URY0 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rtl4Q3URY0 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Rtl4Q3URY0 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Rtl4Q3URY0 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rtl4Q3URY0 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rtl4Q3URY0 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rtl4Q3URY0 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rtl4Q3URY0 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rtl4Q3URY0 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rtl4Q3URY0 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Rtl4Q3URY0 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rtl4Q3URY0 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rtl4Q3URY0 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rtl4Q3URY0 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rtl4Q3URY0 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rtl4Q3URY0 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rtl4Q3URY0 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rtl4Q3URY0 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rtl4Q3URY0 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Rtl4Q3URY0 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Rtl4Q3URY0 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rtl4Q3URY0 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Rtl4Q3URY0 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rtl4Q3URY0 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rtl4Q3URY0 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rtl4Q3URY0 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rtl4Q3URY0 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rtl4Q3URY0 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rtl4Q3URY0 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rtl4Q3URY0 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rtl4Q3URY0 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rtl4Q3URY0 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rtl4Q3URY0 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rtl4Q3URY0 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rtl4Q3URY0 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rtl4Q3URY0 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rtl4Q3URY0 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rtl4Q3URY0 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rtl4Q3URY0 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rtl4Q3URY0 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rtl4Q3URY0 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rtl4Q3URY0 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rtl4Q3URY0 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rtl4Q3URY0 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rtl4Q3URY0 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Rtl4Q3URY0 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rtl4Q3URY0 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rtl4Q3URY0 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rtl4Q3URY0 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Rtl4Q3URY0 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rtl4Q3URY0 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rtl4Q3URY0 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rtl4Q3URY0 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rtl4Q3URY0 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rtl4Q3URY0 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rtl4Q3URY0 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rtl4Q3URY0 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Rtl4Q3URY0 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rtl4Q3URY0 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rtl4Q3URY0 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rtl4Q3URY0 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rtl4Q3URY0 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rtl4Q3URY0 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rtl4Q3URY0 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Rtl4Q3URY0 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rtl4Q3URY0 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rtl4Q3URY0 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rtl4Q3URY0 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rtl4Q3URY0 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rtl4Q3URY0 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rtl4Q3URY0 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rtl4Q3URY0 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rtl4Q3URY0 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rtl4Q3URY0 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rtl4Q3URY0 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rtl4Q3URY0 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Rtl4Q3URY0 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rtl4Q3URY0 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rtl4Q3URY0 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rtl4Q3URY0 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rtl4Q3URY0 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rtl4Q3URY0 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rtl4Q3URY0 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rtl4Q3URY0 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rtl4Q3URY0 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rtl4Q3URY0 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms