Protein–RNA interactions for Protein: Q3URK1

Ccdc190, Coiled-coil domain-containing protein 190, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc190Q3URK1 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc190Q3URK1 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc190Q3URK1 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc190Q3URK1 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc190Q3URK1 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc190Q3URK1 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc190Q3URK1 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc190Q3URK1 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc190Q3URK1 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc190Q3URK1 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc190Q3URK1 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc190Q3URK1 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc190Q3URK1 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc190Q3URK1 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc190Q3URK1 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc190Q3URK1 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc190Q3URK1 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc190Q3URK1 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc190Q3URK1 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc190Q3URK1 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc190Q3URK1 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc190Q3URK1 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc190Q3URK1 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc190Q3URK1 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc190Q3URK1 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc190Q3URK1 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc190Q3URK1 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc190Q3URK1 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc190Q3URK1 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc190Q3URK1 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc190Q3URK1 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc190Q3URK1 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc190Q3URK1 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc190Q3URK1 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc190Q3URK1 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc190Q3URK1 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc190Q3URK1 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc190Q3URK1 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc190Q3URK1 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc190Q3URK1 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc190Q3URK1 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc190Q3URK1 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc190Q3URK1 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc190Q3URK1 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc190Q3URK1 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc190Q3URK1 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc190Q3URK1 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc190Q3URK1 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc190Q3URK1 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc190Q3URK1 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc190Q3URK1 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc190Q3URK1 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc190Q3URK1 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc190Q3URK1 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc190Q3URK1 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc190Q3URK1 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc190Q3URK1 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc190Q3URK1 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc190Q3URK1 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc190Q3URK1 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc190Q3URK1 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc190Q3URK1 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc190Q3URK1 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc190Q3URK1 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc190Q3URK1 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc190Q3URK1 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc190Q3URK1 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc190Q3URK1 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc190Q3URK1 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc190Q3URK1 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc190Q3URK1 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc190Q3URK1 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc190Q3URK1 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc190Q3URK1 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc190Q3URK1 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc190Q3URK1 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc190Q3URK1 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc190Q3URK1 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc190Q3URK1 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc190Q3URK1 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc190Q3URK1 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc190Q3URK1 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc190Q3URK1 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc190Q3URK1 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc190Q3URK1 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc190Q3URK1 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc190Q3URK1 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc190Q3URK1 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc190Q3URK1 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc190Q3URK1 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc190Q3URK1 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc190Q3URK1 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc190Q3URK1 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc190Q3URK1 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc190Q3URK1 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc190Q3URK1 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc190Q3URK1 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc190Q3URK1 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc190Q3URK1 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc190Q3URK1 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms