Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQN2

Fcho2, F-BAR domain only protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 809 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcho2Q3UQN2 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fcho2Q3UQN2 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fcho2Q3UQN2 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fcho2Q3UQN2 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fcho2Q3UQN2 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fcho2Q3UQN2 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fcho2Q3UQN2 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fcho2Q3UQN2 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fcho2Q3UQN2 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fcho2Q3UQN2 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fcho2Q3UQN2 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fcho2Q3UQN2 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fcho2Q3UQN2 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fcho2Q3UQN2 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fcho2Q3UQN2 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fcho2Q3UQN2 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fcho2Q3UQN2 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fcho2Q3UQN2 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fcho2Q3UQN2 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fcho2Q3UQN2 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fcho2Q3UQN2 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fcho2Q3UQN2 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fcho2Q3UQN2 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fcho2Q3UQN2 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fcho2Q3UQN2 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fcho2Q3UQN2 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fcho2Q3UQN2 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fcho2Q3UQN2 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fcho2Q3UQN2 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fcho2Q3UQN2 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fcho2Q3UQN2 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fcho2Q3UQN2 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fcho2Q3UQN2 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fcho2Q3UQN2 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fcho2Q3UQN2 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fcho2Q3UQN2 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fcho2Q3UQN2 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fcho2Q3UQN2 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fcho2Q3UQN2 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fcho2Q3UQN2 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fcho2Q3UQN2 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fcho2Q3UQN2 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fcho2Q3UQN2 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Fcho2Q3UQN2 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fcho2Q3UQN2 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fcho2Q3UQN2 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fcho2Q3UQN2 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fcho2Q3UQN2 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fcho2Q3UQN2 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fcho2Q3UQN2 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fcho2Q3UQN2 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fcho2Q3UQN2 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fcho2Q3UQN2 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fcho2Q3UQN2 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fcho2Q3UQN2 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fcho2Q3UQN2 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fcho2Q3UQN2 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fcho2Q3UQN2 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fcho2Q3UQN2 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fcho2Q3UQN2 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Fcho2Q3UQN2 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Fcho2Q3UQN2 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fcho2Q3UQN2 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fcho2Q3UQN2 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fcho2Q3UQN2 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fcho2Q3UQN2 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fcho2Q3UQN2 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fcho2Q3UQN2 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fcho2Q3UQN2 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fcho2Q3UQN2 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fcho2Q3UQN2 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fcho2Q3UQN2 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fcho2Q3UQN2 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fcho2Q3UQN2 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fcho2Q3UQN2 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fcho2Q3UQN2 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fcho2Q3UQN2 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fcho2Q3UQN2 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fcho2Q3UQN2 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fcho2Q3UQN2 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fcho2Q3UQN2 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fcho2Q3UQN2 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fcho2Q3UQN2 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fcho2Q3UQN2 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fcho2Q3UQN2 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fcho2Q3UQN2 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fcho2Q3UQN2 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fcho2Q3UQN2 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fcho2Q3UQN2 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fcho2Q3UQN2 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fcho2Q3UQN2 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fcho2Q3UQN2 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fcho2Q3UQN2 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fcho2Q3UQN2 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fcho2Q3UQN2 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fcho2Q3UQN2 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fcho2Q3UQN2 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fcho2Q3UQN2 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fcho2Q3UQN2 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fcho2Q3UQN2 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms