Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Skap2Q3UND0 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Skap2Q3UND0 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Skap2Q3UND0 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Skap2Q3UND0 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Skap2Q3UND0 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Skap2Q3UND0 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Skap2Q3UND0 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Skap2Q3UND0 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Skap2Q3UND0 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Skap2Q3UND0 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Skap2Q3UND0 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Skap2Q3UND0 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Skap2Q3UND0 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Skap2Q3UND0 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Skap2Q3UND0 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Skap2Q3UND0 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Skap2Q3UND0 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Skap2Q3UND0 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Skap2Q3UND0 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Skap2Q3UND0 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Skap2Q3UND0 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Skap2Q3UND0 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Skap2Q3UND0 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Skap2Q3UND0 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Skap2Q3UND0 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Skap2Q3UND0 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Skap2Q3UND0 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Skap2Q3UND0 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Skap2Q3UND0 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Skap2Q3UND0 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Skap2Q3UND0 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Skap2Q3UND0 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Skap2Q3UND0 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Skap2Q3UND0 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Skap2Q3UND0 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Skap2Q3UND0 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Skap2Q3UND0 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Skap2Q3UND0 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Skap2Q3UND0 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Skap2Q3UND0 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Skap2Q3UND0 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Skap2Q3UND0 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Skap2Q3UND0 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Skap2Q3UND0 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Skap2Q3UND0 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Skap2Q3UND0 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Skap2Q3UND0 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Skap2Q3UND0 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Skap2Q3UND0 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Skap2Q3UND0 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Skap2Q3UND0 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Skap2Q3UND0 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Skap2Q3UND0 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Skap2Q3UND0 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Skap2Q3UND0 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Skap2Q3UND0 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Skap2Q3UND0 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Skap2Q3UND0 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Skap2Q3UND0 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Skap2Q3UND0 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Skap2Q3UND0 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Skap2Q3UND0 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Skap2Q3UND0 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Skap2Q3UND0 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Skap2Q3UND0 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Skap2Q3UND0 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Skap2Q3UND0 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Skap2Q3UND0 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Skap2Q3UND0 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Skap2Q3UND0 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Skap2Q3UND0 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Skap2Q3UND0 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Skap2Q3UND0 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Skap2Q3UND0 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Skap2Q3UND0 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Skap2Q3UND0 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Skap2Q3UND0 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Skap2Q3UND0 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Skap2Q3UND0 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Skap2Q3UND0 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Skap2Q3UND0 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Skap2Q3UND0 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Skap2Q3UND0 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Skap2Q3UND0 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Skap2Q3UND0 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Skap2Q3UND0 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Skap2Q3UND0 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Skap2Q3UND0 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Skap2Q3UND0 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Skap2Q3UND0 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Skap2Q3UND0 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Skap2Q3UND0 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Skap2Q3UND0 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Skap2Q3UND0 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Skap2Q3UND0 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Skap2Q3UND0 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Skap2Q3UND0 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Skap2Q3UND0 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Skap2Q3UND0 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms