Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMU9

Hdgfl2, Hepatoma-derived growth factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl2Q3UMU9 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hdgfl2Q3UMU9 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hdgfl2Q3UMU9 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms