Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMF0

Cobll1, Cordon-bleu protein-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cobll1Q3UMF0 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cobll1Q3UMF0 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cobll1Q3UMF0 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cobll1Q3UMF0 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cobll1Q3UMF0 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cobll1Q3UMF0 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cobll1Q3UMF0 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cobll1Q3UMF0 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cobll1Q3UMF0 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cobll1Q3UMF0 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cobll1Q3UMF0 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cobll1Q3UMF0 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cobll1Q3UMF0 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cobll1Q3UMF0 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cobll1Q3UMF0 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cobll1Q3UMF0 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cobll1Q3UMF0 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cobll1Q3UMF0 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cobll1Q3UMF0 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cobll1Q3UMF0 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cobll1Q3UMF0 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cobll1Q3UMF0 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cobll1Q3UMF0 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cobll1Q3UMF0 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cobll1Q3UMF0 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cobll1Q3UMF0 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cobll1Q3UMF0 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cobll1Q3UMF0 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cobll1Q3UMF0 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cobll1Q3UMF0 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cobll1Q3UMF0 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cobll1Q3UMF0 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cobll1Q3UMF0 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cobll1Q3UMF0 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cobll1Q3UMF0 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cobll1Q3UMF0 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cobll1Q3UMF0 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cobll1Q3UMF0 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cobll1Q3UMF0 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cobll1Q3UMF0 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cobll1Q3UMF0 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cobll1Q3UMF0 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cobll1Q3UMF0 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cobll1Q3UMF0 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cobll1Q3UMF0 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cobll1Q3UMF0 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cobll1Q3UMF0 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cobll1Q3UMF0 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cobll1Q3UMF0 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cobll1Q3UMF0 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cobll1Q3UMF0 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cobll1Q3UMF0 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cobll1Q3UMF0 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cobll1Q3UMF0 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cobll1Q3UMF0 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cobll1Q3UMF0 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cobll1Q3UMF0 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cobll1Q3UMF0 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cobll1Q3UMF0 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cobll1Q3UMF0 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cobll1Q3UMF0 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cobll1Q3UMF0 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cobll1Q3UMF0 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cobll1Q3UMF0 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cobll1Q3UMF0 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cobll1Q3UMF0 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cobll1Q3UMF0 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cobll1Q3UMF0 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cobll1Q3UMF0 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cobll1Q3UMF0 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cobll1Q3UMF0 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cobll1Q3UMF0 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cobll1Q3UMF0 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cobll1Q3UMF0 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cobll1Q3UMF0 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cobll1Q3UMF0 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cobll1Q3UMF0 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cobll1Q3UMF0 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cobll1Q3UMF0 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cobll1Q3UMF0 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cobll1Q3UMF0 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cobll1Q3UMF0 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cobll1Q3UMF0 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cobll1Q3UMF0 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cobll1Q3UMF0 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cobll1Q3UMF0 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cobll1Q3UMF0 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cobll1Q3UMF0 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cobll1Q3UMF0 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cobll1Q3UMF0 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cobll1Q3UMF0 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cobll1Q3UMF0 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cobll1Q3UMF0 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cobll1Q3UMF0 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cobll1Q3UMF0 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cobll1Q3UMF0 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cobll1Q3UMF0 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cobll1Q3UMF0 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cobll1Q3UMF0 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cobll1Q3UMF0 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms