Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc33Q3ULW6 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc33Q3ULW6 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc33Q3ULW6 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc33Q3ULW6 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc33Q3ULW6 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc33Q3ULW6 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc33Q3ULW6 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc33Q3ULW6 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc33Q3ULW6 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc33Q3ULW6 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc33Q3ULW6 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc33Q3ULW6 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc33Q3ULW6 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc33Q3ULW6 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc33Q3ULW6 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc33Q3ULW6 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc33Q3ULW6 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc33Q3ULW6 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc33Q3ULW6 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc33Q3ULW6 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc33Q3ULW6 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc33Q3ULW6 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc33Q3ULW6 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc33Q3ULW6 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc33Q3ULW6 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc33Q3ULW6 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc33Q3ULW6 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc33Q3ULW6 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc33Q3ULW6 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc33Q3ULW6 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc33Q3ULW6 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc33Q3ULW6 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc33Q3ULW6 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc33Q3ULW6 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc33Q3ULW6 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc33Q3ULW6 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc33Q3ULW6 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc33Q3ULW6 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc33Q3ULW6 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc33Q3ULW6 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc33Q3ULW6 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc33Q3ULW6 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc33Q3ULW6 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc33Q3ULW6 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc33Q3ULW6 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc33Q3ULW6 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc33Q3ULW6 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc33Q3ULW6 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc33Q3ULW6 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc33Q3ULW6 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc33Q3ULW6 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc33Q3ULW6 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc33Q3ULW6 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc33Q3ULW6 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc33Q3ULW6 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc33Q3ULW6 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc33Q3ULW6 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc33Q3ULW6 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc33Q3ULW6 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc33Q3ULW6 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc33Q3ULW6 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc33Q3ULW6 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc33Q3ULW6 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc33Q3ULW6 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc33Q3ULW6 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc33Q3ULW6 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc33Q3ULW6 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc33Q3ULW6 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc33Q3ULW6 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc33Q3ULW6 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc33Q3ULW6 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc33Q3ULW6 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc33Q3ULW6 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc33Q3ULW6 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc33Q3ULW6 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc33Q3ULW6 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc33Q3ULW6 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc33Q3ULW6 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc33Q3ULW6 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc33Q3ULW6 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc33Q3ULW6 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc33Q3ULW6 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc33Q3ULW6 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc33Q3ULW6 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc33Q3ULW6 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc33Q3ULW6 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc33Q3ULW6 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc33Q3ULW6 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc33Q3ULW6 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc33Q3ULW6 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc33Q3ULW6 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc33Q3ULW6 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc33Q3ULW6 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc33Q3ULW6 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc33Q3ULW6 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc33Q3ULW6 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc33Q3ULW6 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc33Q3ULW6 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc33Q3ULW6 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms