Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULQ2

Pin1rt1, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pin1rt1Q3ULQ2 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pin1rt1Q3ULQ2 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pin1rt1Q3ULQ2 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pin1rt1Q3ULQ2 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pin1rt1Q3ULQ2 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Pin1rt1Q3ULQ2 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pin1rt1Q3ULQ2 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Pin1rt1Q3ULQ2 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pin1rt1Q3ULQ2 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pin1rt1Q3ULQ2 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pin1rt1Q3ULQ2 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pin1rt1Q3ULQ2 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pin1rt1Q3ULQ2 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Pin1rt1Q3ULQ2 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pin1rt1Q3ULQ2 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pin1rt1Q3ULQ2 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pin1rt1Q3ULQ2 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pin1rt1Q3ULQ2 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pin1rt1Q3ULQ2 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pin1rt1Q3ULQ2 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pin1rt1Q3ULQ2 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pin1rt1Q3ULQ2 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pin1rt1Q3ULQ2 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pin1rt1Q3ULQ2 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pin1rt1Q3ULQ2 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pin1rt1Q3ULQ2 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pin1rt1Q3ULQ2 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pin1rt1Q3ULQ2 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pin1rt1Q3ULQ2 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pin1rt1Q3ULQ2 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pin1rt1Q3ULQ2 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pin1rt1Q3ULQ2 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pin1rt1Q3ULQ2 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Pin1rt1Q3ULQ2 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pin1rt1Q3ULQ2 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pin1rt1Q3ULQ2 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pin1rt1Q3ULQ2 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pin1rt1Q3ULQ2 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pin1rt1Q3ULQ2 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pin1rt1Q3ULQ2 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pin1rt1Q3ULQ2 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pin1rt1Q3ULQ2 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pin1rt1Q3ULQ2 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pin1rt1Q3ULQ2 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pin1rt1Q3ULQ2 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pin1rt1Q3ULQ2 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pin1rt1Q3ULQ2 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pin1rt1Q3ULQ2 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pin1rt1Q3ULQ2 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pin1rt1Q3ULQ2 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pin1rt1Q3ULQ2 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pin1rt1Q3ULQ2 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pin1rt1Q3ULQ2 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pin1rt1Q3ULQ2 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pin1rt1Q3ULQ2 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pin1rt1Q3ULQ2 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pin1rt1Q3ULQ2 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pin1rt1Q3ULQ2 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pin1rt1Q3ULQ2 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pin1rt1Q3ULQ2 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pin1rt1Q3ULQ2 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pin1rt1Q3ULQ2 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pin1rt1Q3ULQ2 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pin1rt1Q3ULQ2 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pin1rt1Q3ULQ2 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pin1rt1Q3ULQ2 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pin1rt1Q3ULQ2 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pin1rt1Q3ULQ2 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pin1rt1Q3ULQ2 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pin1rt1Q3ULQ2 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pin1rt1Q3ULQ2 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pin1rt1Q3ULQ2 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pin1rt1Q3ULQ2 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pin1rt1Q3ULQ2 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pin1rt1Q3ULQ2 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Pin1rt1Q3ULQ2 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pin1rt1Q3ULQ2 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pin1rt1Q3ULQ2 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pin1rt1Q3ULQ2 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pin1rt1Q3ULQ2 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pin1rt1Q3ULQ2 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms