Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKU1

Ell2, RNA polymerase II elongation factor ELL2, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ell2Q3UKU1 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ell2Q3UKU1 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ell2Q3UKU1 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ell2Q3UKU1 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ell2Q3UKU1 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Ell2Q3UKU1 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ell2Q3UKU1 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ell2Q3UKU1 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ell2Q3UKU1 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ell2Q3UKU1 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ell2Q3UKU1 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ell2Q3UKU1 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ell2Q3UKU1 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ell2Q3UKU1 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ell2Q3UKU1 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ell2Q3UKU1 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Ell2Q3UKU1 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ell2Q3UKU1 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Ell2Q3UKU1 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ell2Q3UKU1 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ell2Q3UKU1 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ell2Q3UKU1 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ell2Q3UKU1 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ell2Q3UKU1 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ell2Q3UKU1 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ell2Q3UKU1 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ell2Q3UKU1 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ell2Q3UKU1 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ell2Q3UKU1 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ell2Q3UKU1 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ell2Q3UKU1 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ell2Q3UKU1 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ell2Q3UKU1 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Ell2Q3UKU1 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ell2Q3UKU1 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ell2Q3UKU1 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ell2Q3UKU1 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ell2Q3UKU1 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ell2Q3UKU1 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ell2Q3UKU1 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ell2Q3UKU1 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ell2Q3UKU1 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ell2Q3UKU1 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ell2Q3UKU1 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ell2Q3UKU1 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ell2Q3UKU1 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ell2Q3UKU1 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ell2Q3UKU1 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ell2Q3UKU1 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ell2Q3UKU1 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ell2Q3UKU1 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ell2Q3UKU1 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ell2Q3UKU1 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ell2Q3UKU1 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ell2Q3UKU1 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ell2Q3UKU1 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ell2Q3UKU1 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ell2Q3UKU1 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ell2Q3UKU1 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Ell2Q3UKU1 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ell2Q3UKU1 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ell2Q3UKU1 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ell2Q3UKU1 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ell2Q3UKU1 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ell2Q3UKU1 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ell2Q3UKU1 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ell2Q3UKU1 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ell2Q3UKU1 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ell2Q3UKU1 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ell2Q3UKU1 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ell2Q3UKU1 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ell2Q3UKU1 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ell2Q3UKU1 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ell2Q3UKU1 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ell2Q3UKU1 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Ell2Q3UKU1 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ell2Q3UKU1 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ell2Q3UKU1 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ell2Q3UKU1 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ell2Q3UKU1 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ell2Q3UKU1 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ell2Q3UKU1 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ell2Q3UKU1 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ell2Q3UKU1 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ell2Q3UKU1 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ell2Q3UKU1 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ell2Q3UKU1 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ell2Q3UKU1 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ell2Q3UKU1 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Ell2Q3UKU1 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ell2Q3UKU1 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ell2Q3UKU1 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ell2Q3UKU1 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ell2Q3UKU1 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ell2Q3UKU1 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ell2Q3UKU1 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ell2Q3UKU1 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ell2Q3UKU1 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ell2Q3UKU1 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ell2Q3UKU1 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms